南海海区鲻鱼(Mugil cephalus)COⅠ基因序列的遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙鹏

作者： 孙鹏;彭士明;尹飞;施兆鸿

作者机构：

关键词： 鲻鱼;线粒体DNA;细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ);遗传多样性

期刊名称： 海洋与湖沼

ISSN： 0029-814X

年卷期： 2011 年 42 卷 01 期

页码： 131-136

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)序列研究了南海海区鲻鱼群体的遗传多样性水平和遗传结构。通过PCR扩增与序列测定获得了长度为621bp的基因片段。在35个样品中共发现47处碱基变异,A、T、G、C碱基的平均含量分别为31.6%、24.1%、25.0%和19.2%。35条COⅠ序列共定义了25个单倍型,存在47个多态性位点,产生49个突变。其中,简约信息位点有36个,占总位点数的5.8%,同义替换位点7个,占总变异位点的14.9%,没有发现插入或缺失现象。单倍型多样性(Hd)为0.9563,核苷酸多样性(Pi)为0.02795,平均碱基差异(K)为17.36。Tajima’sD中性检验结果为1.29916,但差异不显著(P>0.10)。采用邻接法(NJ)和非加权配对算术平均法(UPGMA)构建分子系统树,所有的25个单倍型被分成两个分支。结果表明,南海海区鲻鱼种群具有较高的遗传多样性水平。其结果可以为合理开发和利用鲻鱼野生资源,以及建立和保护鲻鱼种质资源提供必要的参考。

分类号： S917.4

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