大豆NIP类水孔蛋白基因的鉴定及表达特性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴伟

作者： 吴伟;冯志娟;徐盛春;刘娜;张古文;胡齐赞;龚亚明

作者机构：

关键词： 大豆;NIP;水孔蛋白;全基因组鉴定;组织表达;干旱应答

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2018 年 07 期

页码： 1101-1109

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： NIPs(nodulin 26-like intrinsic proteins)是类根瘤菌26膜内在蛋白,属于水孔蛋白的一个亚类,在植物逆境胁迫应答过程中发挥重要作用。利用大豆基因组数据库,在全基因组水平共鉴定得到13个GmNIPs。染色体定位分析显示,这些GmNIPs基因分布在大豆11条染色体上。理化性质分析显示,GmNIPs蛋白氨基酸数目为261~296,蛋白分子量为27~32 ku,蛋白等电点为6~10。蛋白多序列比对分析发现,所有GmNIPs均含有水通道蛋白的典型结构,6个保守的跨膜螺旋(TM1-TM6)和2个保守的氨基酸元件NPA盒(Asp-ProAla box)。进化树分析发现,大豆GmNIPs与拟南芥和水稻NIPs分类完全一致。基因结构分析显示,所有GmNIPs基因均由5个外显子和4个内含子组成。启动子分析表明,多数GmNIPs基因的上游启动子区含有逆境和激素应答元件。组织表达分析发现,5个GmNIPs的基因表达量相对较高。进一步,利用荧光定量PCR对Gm NIP1;5的干旱胁迫表达特性进行了分析。

分类号： S565.1

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