贝母属植物叶绿体基因组候选SNP位点应用分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 兰青阔

作者： 兰青阔;赵新;陈锐;王成;陈笑芸;汪小福;王永;兰璞

作者机构：

关键词： 贝母属;叶绿体基因组;SNP位点;生物信息学分析;检测方法

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 01 期

页码： 231-237

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 贝母属植物是中国中药材的宝库,由于形态上难以区分,在民间应用、临床应用和中药市场中还存在混淆应用、以次充好的现象,急需开发基于新型分子标记位点的精准检测方法。本研究应用多重序列比对、SNP筛选等生物信息学分析手段,对贝母属15种植物28条叶绿体基因组序列进行分析。结果发现,贝母属叶绿体基因组DNA同源性达97.22%,通过分析共发现SNP位点5 879个,其中川贝母类鉴别候选位点71个,川贝母鉴别候选位点4个,瓦布贝母鉴别候选位点37个,太白贝母鉴别候选位点147个,浙贝母鉴别候选位点91个,湖北贝母鉴别候选位点271个,平贝母鉴别候选位点1 393个,伊贝母鉴别候选位点89个。本研究还对SNP位点在精准鉴定、精确定量应用方面进行了讨论,可为川贝母中药资源鉴定提供技术支撑。

分类号： S567.231

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