一个小麦AP2/ERF转录因子家族单独亚族基因的克隆及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 庄静

作者： 庄静;陈建民;彭日荷;高峰;朱波;付晓燕;熊爱生;姚泉洪

作者机构：

关键词： 小麦;AP2/ERF转录因子;基因克隆

期刊名称： 麦类作物学报

ISSN： 1009-1041

年卷期： 2009 年 29 卷 05 期

页码： 18-25

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： AP2/ERF家族转录因子是植物中重要的一类转录因子,广泛参与植物各类生理过程。为了给该家族转录因子的深入研究提供基础,利用小麦EST数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/UGOrg.cgi?TAXID=4565),以拟南芥AP2/ERF家族转录因子单独亚族成员AtAP2-Soloist的氨基酸序列为探针,搜索到一个小麦UniGene数据,经拼接得到1个全长cDNA序列(TaAP2-Solosit),通过RT-PCR方法从"扬麦15"的cDNA中克隆了该转录因子基因(YM15 AP2-Solosit)。克隆的转录因子核苷酸序列与电子克隆的序列只有1个碱基不同,两者编码氨基酸序列一致。从cDNA序列、氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、进化树、功能域、二级和三级结构等方面进行了分析,结果显示"扬麦15"中的YM15 AP2-Solosit转录因子属于AP2/ERF家族中的单独亚族,是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与拟南芥的AtAP2-Soloist相似。EST丰度分析显示,YM15 AP2-Solosit在根、茎、叶和花中均有表达。

分类号： S512.1

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