植物鸟氨酸脱羧酶家族基因鉴定及进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王鹏

作者： 王鹏;罗朝鹏;盖江涛

作者机构：

关键词： 鸟氨酸脱羧酶;精氨酸脱羧酶;基因家族;进化

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 96-101

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 精氨酸脱羧酶(ADC)和鸟氨酸脱羧酶(ODC)共同负责腐胺的合成,而烟草等茄科植物中,因为腐胺是尼古丁的前体,ADC、ODC对于尼古丁合成具有特殊意义。为系统梳理ODC和ADC在植物基因组中的状况,我们对其基因进行了全面的鉴定和进化分析,并重点考察了其在茄科植物番茄中的表达。首先,我们从已阐明功能的ADC和ODC蛋白序列中,均鉴定了两个保守结构域;在此基础上,结合HMMER和BLAST,从10个植物基因组中共鉴定得到了46个鸟氨酸脱羧酶家族基因。对其构建进化树,发现它们分成3个亚家族:ODC、ADC和DapDc;这些基因均为脱羧酶基因。人类和酵母基因均聚在ODC这一枝,表明ODC在本家族中进化最早。拟南芥和苔藓中均不存在ODC基因,表明此基因在这两个植物基因组中发生了丢失。ADC基因在植物登陆后才得以进化形成。DapDc基因数目极为保守,表明它在植物进化过程中受到了严格的控制。

分类号： Q943.2

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