林木植物的全基因组选择

文献类型： 中文期刊

第一作者： 田郎

作者： 田郎

作者机构：

关键词： 基因组选择;有效群体大小;连锁不平衡;标记辅助选择(MAS)

期刊名称： 陕西林业科技

ISSN： 1001-2117

年卷期： 2015 年 04 期

页码： 115-131

摘要： 基因组选择(GS,也称全基因组选择)是利用捕捉到一个乃至多个数量性状大多数基因位点的全基因组标记估计基因组育种值(即所有标记效应的总和),并以此对目标性状进行选择的方法。目前,这种新的选择方法正在给家畜育种实践带来一场革命性的变化。同样的方法和设想也适用于林木育种。事实上,漫长的世代时间以及大多数复杂性状晚期表达的特性历来都是林木育种所面临的巨大困难和挑战。不仅如此,林木植物还具备诸多其它的有利条件有助于GS的开展和应用,例如:易于收集并建立较大的参考群体且某些性状已作过准确的表型分析;一些改良群体的连锁不平衡(LD)程度较高,这其中包括林木高世代育种程序中所常用到的一些有效群体大小(Ne)较小的群体。本研究利用确定性方程就LD(通过Ne和标记间距离进行模拟),训练集的大小,性状遗传力,以及数量性状位点(QTL)的数目等因素对GS的预期准确性的影响进行了分析评估。结果显示,GS有可能使树木育种的有效性得到根本性的提高。当Ne≤30时,即便标记密度仅大约2个标记/厘摩(cM),采用GS就能达到传统BLUP(最佳线性无偏预测)选择的基准精度。不过,当Ne较大时,标记密度则需达到20个标记/cM。采用GS可使育种周期缩短50%,进而使育种效率增加100%或以上。随着技术的快速进步和基因分型成本的下降,我们谨慎而乐观地看好GS在加速树木育种进程和提高育种效率上的巨大潜力。不过,在将此项技术推广应用之前,尚需作进一步的模拟研究及概念验证试验。

分类号： S718.4

  • 相关文献

[1]半滑舌鳎有效群体大小估计. 王伟峰,崔瑜,蒋丽,王悦玲,王焕岭,李恒德. 2019

[2]标记辅助选择及其研究进展. 王曦,许尚忠,周忠孝. 2002

[3]基于表型和DNA分子标记的菊花种质研究进展. 许兰杰,余永亮,杨红旗,谭政委,杨青,安素妨,董薇,李磊,鲁丹丹,梁慧珍. 2024

[4]标记辅助选择在猪育种中应用效果的研究. 李娅兰,张豪,张勤,王青来,陈瑶生. 2009

[5]分子遗传技术在家畜遗传评定中的应用. 狄江,王琼,拉扎提. 2009

[6]基因组选择方法研究进展. 王欣,孙辉,胡中立,徐辰武. 2018

[7]基因组选择及其在水产动物育种中的研究进展. 宋海亮,胡红霞. 2022

[8]猪基因组选择"两步走"策略的计算机模拟评估. 唐振双,殷东,尹立林,马云龙,项韬,朱猛进,余梅,刘小磊,李新云,邱小田,赵书红. 2021

[9]对比Bayesian B等多种方法的大豆全基因组选择应用研究. 唐友,郑萍,王嘉博,张继成. 2018

[10]畜禽基因组选择方法研究进展. 鲍晶晶,张莉. 2020

[11]动物分子育种技术在反刍动物育种中的研究进展. 林秀蔚,韩永胜,王洪宝,丁得利,刘文,姚美玲,李青莹,王艳菲,朱元芳. 2024

[12]基因组选择背景下奶牛体外受精的40年. 蔡高占,张汝美,王亚琴,黄国锋,李俊婷,刘小涛,姚文龙,周浩,李建斌,仲跻峰. 2021

[13]基于基因组选择分析解析中国美利奴羊(OAR2)脱毛症的遗传规律. 李亮,胡登林,罗鹏辉,杨会国. 2022

[14]丹系猪及我国猪遗传育种的研究进展. 袁颖琳,白江松,杜建勇,苏国生,张勤,王晓. 2023

[15]中国种业科技创新的智能时代——“玉米育种4.0”. 王向峰,才卓. 2019

[16]金陵花鸡基因组选择效果分析. 杜永旺,黄超,王一东,蔡日春,余洋,赵桂苹,郑麦青. 2023

[17]基因组选择及其在作物育种中的应用. 陈雨,姜淑琴,孙炳蕊,潘大建,范芝兰,陈文丰,李晨. 2017

[18]基因组选择育种探讨. 吴建忠. 2022

[19]基因组选择在反刍动物中的应用与研究进展. 王海锋,李诚兰,岳耀敬. 2024

[20]基因组育种值估计的贝叶斯方法. 王重龙,丁向东,刘剑锋,殷宗俊,张勤. 2014

作者其他论文 更多>>

微信小程序