基于转录组百合WRKY转录因子的挖掘与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周俐宏

作者： 周俐宏;石慧;李雪艳;王伟东;白一光;胡新颖;杨迎东

作者机构：

关键词： 百合;WRKY;序列分析;系统进化

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 007 期

页码： 2144-2151

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WRKY是一类与植物生物胁迫反应相关的转录因子，是植物中特有的超基因家族。为了挖掘百合抗蚜虫胁迫相关的WRKY基因，本研究利用棉蚜胁迫的百合转录组数据，对WRKY进行筛选及保守结构域分析，对鉴定出的WRKY转录因子进行生物信息学分析。结果表明：百合中筛选的29个WRKY基因的蛋白为99～675个氨基酸，理论等电点的范围为5.06～11.19。在LhWRKY基因编码的所有蛋白中，其中LhWRKY5和LhWRKY26为稳定蛋白，其余LhWRKY属于不稳定蛋白。所有LhWRKY蛋白均定位于细胞核，属于亲水性蛋白。除LhWRKY2、LhWRKY3、LhWRKY5、LhWRKY20四个蛋白外，均具有丝氨酸（Ser）、苏氨酸（Thr）和酪氨酸（Tyr）磷酸化位点。LhWRKY包含三类WRKY转录因子，部分蛋白发生变异。系统进化树发现，有3个WRKY基因与已知抗生物胁迫基因同源性较高，推测其参与百合抗蚜胁迫反应。研究结果可以通过筛选的WRKY基因，进行进一步的功能验证，为植物抗生物胁迫尤其是抗蚜育种提供分子基础。

分类号： S682.29

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