椰子开花相关miR156和靶基因SPL特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 冯雅兰

作者： 冯雅兰;肖勇;王永;张大鹏;石鹏;夏薇;孙熹微

作者机构： 海南大学热带作物学院;中国热带农业科学院椰子研究所海南省热带油料作物生物学重点实验室

关键词： 椰子（Cocos nucifera L.）;miR156;靶基因;开花

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 012 期

页码： 3894-3901

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了揭示椰子CnumiR156基因家族的进化过程和表达模式，对CnumiR156家族9个成员的序列进行生物信息学分析及靶基因预测，找出开花途径靶基因，并结合转录数据对这差异表达的CnumiR156和开花途径靶基因进行RT-qPCR验证。序列比对发现不同的前体序列可产生相同序列的成熟miR156；进化树结果表明，CnumiR156-1和CnumiR156-3的亲缘关系较近，CnumiR156-2和CnumiR156-5的亲缘关系较近，CnumiR156-4和CnumiR156-9的亲缘关系较近；靶基因预测结果表明，CnmiR156-3/-6的靶基因主要是SQUAMOS启动子结合蛋白家族；转录组数据结果分析得到，CnumiR156-3、CnumiR156-6、CnumiR156-9在‘本地高种’和‘黄矮’苗期的表达量要高于在其对应成熟期的表达，开花途径靶基因CnSPL （CCG024262.1）和CnSPL （CCG019030.1）在‘本地高种’和‘黄矮’成熟期的表达量要高于在其对应苗期的表达；CCG024262.1和CCG019030.1的定量结果与转录组结果基本相符。本研究通过生信分析与实验验证对CnumiR156和开花途径靶基因CnSPL的序列特征与表达模式进行分析，给CnumiR156和靶基因CnSPL的功能研究提供理论基础，为椰子的生物育种提供一个新的思路。

分类号： S667.4

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