甜橙乙烯诱导酯酶基因家族的进化

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王萱

作者： 王萱;吴波;程春振;姜波;钟广炎

作者机构：

关键词： 甜橙;乙烯诱导酯酶;家族基因;进化

期刊名称： 广东农业科学

ISSN： 1004-874X

年卷期： 2014 年 41 卷 10 期

页码： 135-145

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了解甜橙乙烯诱导酯酶基因(Citrus sinensis Ethylene-induced esterase gene,CsEIE)家族成员的进化历史与功能分化,检索比对了甜橙基因组、TAIR数据库、Phytozome数据库和NCBI EST数据库中多个物种的EIE家族基因,分析了甜橙中该基因家族的全部18个成员的基因结构、染色体分布、蛋白结构域、保守序列、基因表达、进化选择方向以及系统发生关系。结果表明,CsEIE家族成员分布在4条染色体中,通常呈串联重复排列;不同基因的外显子数目变异范围为1~5;该基因家族绝大多数成员含有3个保守基序。系统发生学分析结果显示,被子植物EIE家族基因聚为3个分支,表明EIE基因家族是在被子植物分支前就已存在的古老的多基因家族,家族成员目前的分布现状是基因不断重复和丢失的结果。系统发生树中,甜橙CsEIE1~CsEIE8属于同一分支,推测其是在柑桔与研究中其他物种分化后经多次基因重复事件产生。该分支在其他被子植物中也同样有多个经独立基因重复事件形成的旁系同源,而另外两支中发生的重复事件要少得多。表达分析结果显示,CsEIE基因家族在转录活性、表达模式上已经出现了较大的分化。所有结果表明CsEIE基因家族仍在扩张,各成员在经受不同的选择压力。

分类号： S666.4

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