烟草野火病菌Pseudomonassyringaepv.tabaciyuexi-1信号肽预测及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王铁霖

作者： 李晶;杨玉文;赵廷昌

作者机构：

关键词： Pseudomonassyringaepv.tabaci;信号肽;SignalP4.0;LipoP1.0;TMHMMv2.0

期刊名称： 中国烟草学报

ISSN：

年卷期： 2016 年 01 期

页码： 92-100

收录情况： CSCD

摘要： 利用SignalP4.0、LipoP1.0及TMHMMv2.0对烟草野火病菌Pseudomonassyringaepv.tabaciyuexi-1菌株基因组中信号肽的数量、长度和氨基酸组成进行了预测及分类。结果确定其中432个ORFs(Openreadingframe)所编码的N端有信号肽序列,占全部ORFs的8.81%。其中351条分泌型信号肽(SPI),81条脂蛋白型信号肽(SPII)。在分泌型信号肽中,信号肽的长度为11~42个氨基酸,以长度为22个氨基酸的信号肽最多。同源性分析结果显示,具有相同信号肽序列的不同蛋白序列之间是高度保守的。该研究提供了野火病原菌致病因子...

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