棉花黄萎病菌ITS序列的获得及系统进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 丁锦平

作者： 丁锦平;刘冬梅;李付广;朱荷琴;李成伟

作者机构： 商丘师范学院生命科学系植物与微生物互作重点实验室;中国农业科学院棉花研究所农业部棉花遗传改良重点开放实验室;商丘师范学院生命科学系植物与微生物互作重点实验室;中国农业科学院棉花研究所农业部棉花遗传改良重点开放实验室;周口师范学院生命科学系植物遗传与分子育种重点实验 室

关键词： 棉花;黄萎病菌;ITS序列;系统进化树

期刊名称： 贵州农业科学

ISSN： 1001-3601

年卷期： 2011 年 39 卷 10 期

页码： 118-121

收录情况： 北大核心

摘要： 为探明从河南安阳棉区分离的棉花黄萎病菌的系统进化关系,利用真菌内转录间隔区通用引物ITS1和ITS4对来自安阳地区的棉花黄萎病菌内转录间隔区(ITS)进行PCR扩增,得到542bp大小的片段,经过克隆、测序和在GenBank中进行BLASTN分析,证明了该片段来自大丽轮枝菌的ITS区,也进一步证明该棉花黄萎病菌是大丽轮枝菌。同时,对该序列在NCBI的GenBank进行了登记,登记号为EU835817。利用该ITS序列与GenBank中搜索到的黄萎病菌ITS序列一起构建了相应黄萎病菌的系统进化树,在进化树上所搜索到的13个大丽轮枝菌都聚类到一个进化枝上,而且中国报道的植物黄萎病菌,包括安阳地区黄萎病菌在内的3个大丽轮枝菌在进化树上处于相邻的位置,表明:这3个菌可能具有相同的起源。这些结果有助于理解棉花黄萎病安阳菌株的进化地位,该ITS序列还可以应用于棉花黄萎病安阳菌株的特异分子鉴定。

分类号： S435.621

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