2020-2024年广西H3N2亚型禽流感病毒HA和NA基因分子特征分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 尹彦文

作者： 尹彦文;熊陈勇;韦伟;施开创;郑敏;崔鹏飞;韦显凯;李致远;刘惠心;冯淑萍;卢春花;屈素洁;陆文俊;李雪珍;王睿敏;邓国华;欧长波

作者机构：

关键词： 禽流感病毒;H3N2亚型;遗传进化;相似性

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2025 年 52 卷 009 期

页码： 4358-4367

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]探究H3N2亚型禽流感病毒(AIV)广西毒株分子遗传进化特征.[方法]采集2020-2024年广西各地的家禽咽拭子和肛拭子病料,采用实时荧光定量RT-PCR方法鉴别检测H3N2亚型AIV,选取部分阳性样本经尿囊腔接种SPF鸡胚,收集鸡胚尿囊液,提取核酸后通过PCR扩增血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因并测序,进行序列相似性、系统发育、氨基酸变异位点及遗传进化速率分析.[结果]共获得43株HA和NA基因序列,编码区大小为1 701和1 410 bp.相似性比对分析显示,本研究获得的HA和NA基因之间核苷酸序列相似性分别为86.0%~99.9%和89.7%~99.9%,与GenBank中禽源、人源、猪源和犬源核苷酸序列相似性分别为78.4%~99.7%和78.1%~99.1%.广西H3N2亚型AIV毒株HA和NA基因属于欧亚谱系,与禽源亲缘关系最近,与人源/猪源最远.HA 蛋白在第 18-20、22-24、38-40、54-56、61-63、181-183、301-303 和 499-501 位氨基酸处出现糖基化,NA 蛋白在第 61-63、69-71、86-88、143-145、146-148、200-202、234-236、313-315 和 402-404位氨基酸处出现糖基化,部分氨基酸位点发生变异;HA蛋白裂解位点为340PEKQTR ↓ GLF348和340PERQTR↓ GLF348.遗传进化速率估算结果显示,HA和NA基因遗传进化速率分别为3.26×10-3和3.67× 10-3替换/(位点·年),HA基因种群规模在不同时间段表现出不同的动态进化特征.[结论]H3N2亚型AIV广西流行毒株与同种流行毒株亲缘性较近,部分HA和NA蛋白发生特有氨基酸突变,不同种属毒株进化趋势不一致,具有遗传多样性特征.试验结果为防控H3N2亚型AIV提供基础数据.

分类号： S852.65+9.2

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