贵州禾落粒性基因qSH1调控区SNP分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨奕

作者： 杨奕;马继琼;孙一丁;许明辉

作者机构：

关键词： 贵州禾;落粒性;qSH1;序列分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 1910-1918

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 贵州禾是在贵州省黔东南地区种植的一类特殊的稻种,为探究其遗传特性,本研究对49份贵州禾和来源中国11个省市（自治区）和韩日的112份稻种的落粒性基因qSH1调节区序列进行测序分析。结果表明,161份供试品种在696个碱基序列上存在13个变异位点,归为6种DNA单倍型,在功能位点12 290上,仅H6为T,属不易落粒单倍型,其余单倍型均为G,属易落粒单倍型。贵州地方稻（包括贵州禾）出现了所有的6种单倍型,H5为优势单倍型,占85.48%,云南地方稻仅出现H2、H3、H5这3种单倍型,H3为优势单倍型,占62.49%,两省地方稻在基因型种类和优势单倍型上均存在差异。其余稻种（包括日韩品种）全归为H5、H6两种单倍型,中国北方省份80.95%品种归属单倍型H6,南方省份85.71%选育品种归于易落粒单倍型H5,南北方在优势单倍型上存在差异。49份贵州禾归为H1、H4、H5这3种单倍型,H1、H4仅在贵州禾中出现,H5为优势单倍型,占91.84%,贵州禾外的13份贵州地方水稻品种归为H2、H3、H5、H6这4种单倍型,H5是优势类型,占61.54%,贵州禾和贵州其他地方品种在基因型种类和优势单倍型频率上均存在差异。贵州禾q SH1基因型均属易落粒类型,不能解释其不易落粒的特性,推测qSH1另有调控机制或qSH1不是贵州禾落粒性的主要驯化位点。

分类号： S511

  • 相关文献

[1]江苏省和东北地区杂草稻落粒性基因的序列分析. 王军,徐详,杨杰,王芳权,范方军. 2014

[2]广东雷州杂草稻sh4和qSH1基因的功能SNP位点序列分析. 夏启玉,曹扬,孔华,李美英,张丽丽,贺萍萍,张雨良,郭安平. 2020

[3]利用CRISPR/Cas9技术创制水稻落粒性基因qSH1突变体及突变特征分析. 盛夏冰,汪雪峰,谭炎宁,孙志忠,余东,袁贵龙,袁定阳,段美娟. 2019

[4]利用CRISPR/Cas9基因组编辑技术定向降低水稻落粒性. 盛夏冰,谭炎宁,孙志忠,余东,汪雪峰,袁贵龙,袁定阳,段美娟. 2018

[5]基于KASP标记的贵州禾群体遗传多样性与结构分析. 吴娴,徐海峰,张志斌,王倩,宫彦龙,张习春,龙思芳,罗秦欢,宋莉,王忠妮,朱速松. 2021

[6]中国稀有稻类贵州禾的广亲和性测定及评价. 倪克鱼,孙灿慧. 2000

[7]贵州地方稻种Wx基因序列多样性分析. 孙一丁,马继琼,杨奕,陈惠查,焦爱霞,谭金玉,阮仁超,许明辉. 2019

[8]Pikh,Pi2,Pi9,Pi5 4个稻瘟病抗性基因在贵州禾中的分布. 马继琼,孙一丁,杨奕,李进斌,陈惠查,焦爱霞,谭金玉,阮仁超,许明辉. 2018

[9]贵州禾苟当1号在不同海拔及密度下的产量. 唐会会,郑桂云,徐海峰,雷月,李佳丽,刘鹏霖,李祖军,江学海,朱速松. 2021

[10]基于主成分和聚类分析的不同品种贵州禾酿酒适宜性品质评价. 雷月,宫彦龙,唐会会,李祖军,朱速松,张玉珊. 2023

[11]贵州稻种禾类种质资源耐冷性和抗旱性鉴定与评价利用. 陈惠查,张再兴,阮仁超,杨玉顺,金桃叶,游俊梅. 1999

[12]Pikh,Pi2,Pi9,Pi5 4个稻瘟病抗性基因在贵州禾中的分布. 马继琼,孙一丁,杨奕,李进斌,陈惠查,焦爱霞,谭金玉,阮仁超,许明辉. 2018

[13]水稻落粒性的分子生物学研究进展. 宋颖娉,宋立明. 2015

[14]禾本科牧草种子的落粒性. 范树高,王彦荣,张妙青,刘文献,谢文刚. 2013

[15]牧草种子生产中落粒性的影响因素与防控技术. 成苗苗,张美艳,蔡明,黄梅芬,钟声. 2014

[16]适宜机械化栽培的水稻品种筛选研究. 穆麒麟,游艾青,王松,田小海. 2021

[17]垂穗披碱草落粒性评价及农艺性状的相关性分析. 赵永强,张俊超,赵旭红,张宗瑜,张建全,王彦荣,谢文刚. 2017

[18]利用染色体片段置换系定位水稻落粒性主效QTL. 朱文银,杨德卫,林静,赵凌,张亚东,朱镇,陈涛,王才林. 2008

[19]江苏省扬中杂草稻生物学特性初步研究. 杨杰,仲维功,陈志德,王军,汤陵华,闵思桂. 2007

[20]贵州高原粳稻与矮秆籼稻杂交后代落粒性遗传分析. 陈文强,沈福成. 1991

作者其他论文 更多>>

微信小程序