基于SNP和InDel标记的巴西木薯遗传多样性与群体遗传结构分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙倩

作者： 孙倩;邹枚伶;张辰笈;江思容;Eder Jorge de Oliveira;张圣奎;夏志强;王文泉;李有志

作者机构：

关键词： 木薯;SNP;InDel;遗传多样性;群体结构

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2021 年 001 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了对巴西木薯种质资源进行遗传多样性、亲缘关系和群体遗传结构分析,本研究利用了7946个SNPs和1997个InDels分子标记,通过ADMIXTURE软件进行群体结构分析、GCTA软件进行主成分分析.结果显示,巴西木薯被划分为9个亚群.这与利用PHYLIP进行的聚类分析结果大概一致,其中亚群1、亚群2、亚群4、亚群6和亚群8能较好地分别聚在一起,而其他亚群中的样品大致能聚在一起,且样品间有一定的交叉.巴西木薯种质资源遗传多样性指数(0.274)高于中国、尼日利亚等,其中巴西木薯亚群5具有相对较高的遗传多样性水平(0.29).巴西木薯各亚群的群体遗传分化程度较低(群体分化指数在0.03~0.15之间),但高于中国木薯种质资源的群体分化指数.各木薯材料间的遗传距离变幅为0.084~0.297,平均遗传距离为0.228.本研究结果可为后续关联分析发掘优良等位基因及引种提供依据.

分类号： S533

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