2016～2017年中国沿海省市虾类偷死野田村病毒(CMNV)分子流行病学调查

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李小平

作者： 李小平;万晓媛;张庆利;黄倢;董宣;王秀华;邱亮;宋增磊;程东远

作者机构：

关键词： 偷死野田村病毒;分子流行病学调查;逆转录套式PCR;逆转录环介导等温扩增;TaqMan实时荧光定量RT-PCR;行动障碍野田村病毒

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 2095-9869

年卷期： 2019 年 40 卷 02 期

页码： 65-73

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 偷死野田村病毒(CMNV)引起的病毒性偷死病(VCMD)使中国对虾养殖业遭受了严重的经济损失,为查明CMNV及其变异株的分子流行病学特征,本研究采用逆转录套式PCR (RT-nPCR)、逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP)和TaqMan实时荧光定量PCR(TaqMan RT-qPCR) 3种方法,对2016～2017年中国沿海省市CMNV及一种新型野田村病毒——行动障碍野田村病毒(MDNV)的流行、分布和变异情况进行了分析。结果显示,养殖凡纳滨对虾、中国明对虾、日本囊对虾、斑节对虾和罗氏沼虾等种类中均可检测到CMNV阳性;在河北、山东、浙江、福建、广东和海南等省市采集的患病对虾中均存在CMNV。基于RT-nPCR、RT-LAMP和TaqMan RT-qPCR的检测结果显示,2016和2017年样品中CMNV的阳性检出率依次分别为11.8%和7.8%,6.7%和3.9%,17.7%和12.4%;基于上述3种方法检测结果计算得出,2016和2017年样品中CMNV的阳性检出率分别为26.8%和16.3%;基于RT-LAMP的分析显示,2016年样品中MDNV的阳性检出率为9.4%。本研究表明,中国沿海省市养殖虾类中VCMD的流行和危害仍不容忽视,RNA依赖的RNA聚合酶基因不断变异导致前期基于该基因开发的CMNV检测方法可靠性下降,检出假阴性风险升高;同时,发病对虾中出现了新的野田村病毒株系且具有较高的流行率,其传播危害风险值得高度关注。

分类号： S945.1

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