辣椒14-3-3蛋白基因家族全基因组鉴定与表达特征分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 桑婷
作者: 桑婷;颜秀娟;裴红霞;高晶霞;王学梅
作者机构:
关键词: 辣椒;14-3-3基因家族;GRF;全基因组鉴定;表达特征
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2021 年 016 期
页码: 5268-5278
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 14-3-3蛋白(GRF)基因家族通过与靶蛋白相互作用,广泛参与植物激素信号转导和生理代谢过程,在植株生长发育和逆境响应中发挥重要作用。本研究以辣椒(Capsicum annuum)为材料,利用生物信息学研究方法,鉴定得到15个辣椒14-3-3基因家族成员,命名为CaGRF1~CaGRF15。系统分析了CaGRF基因家族成员的结构、进化关系、启动子顺式作用元件、组织及冷胁迫表达,并对CaGRF蛋白互作网络进行预测。结果表明,根据进化关系CaGRF家族成员被分为ε类和非ε类,ε类CaGRF含有更多外显子和内含子;启动子序列分析发现CaGRF启动子中有多个响应激素、胁迫、光的顺式作用元件;表达分析表明CaGRF各成员在辣椒各组织和冷胁迫响应中特异性表达;蛋白互作网络预测发现CaGRF可能与氮代谢、质子转运、转录调控相关蛋白互作。本研究为深入研究辣椒14-3-3家族成员功能及调控途径提供了参考。
分类号: S641.3
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