捻转血矛线虫耐伊维菌素候选基因的多态性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 罗晓平

作者： 罗晓平;李军燕;高娃;耿万恒;王瑞;胡薇;乔蕾;邵国玉;杨晓野

作者机构：

关键词： 伊维菌素;捻转血矛线虫;耐药性;候选基因;单核苷酸多态性

期刊名称： 中国寄生虫学与寄生虫病杂志

ISSN： 1000-7423

年卷期： 2022 年 40 卷 004 期

页码： 536-539,544

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 提取对伊维菌素敏感及耐药的捻转血矛线虫各50条单条虫体全基因组DNA,PCR扩增耐伊维菌素候选基因HCOI00378500、HCOI00506600和HCOI01200700的目的片段后测序,序列使用Lasergene 7.0软件中的SeqMan程序进行人工校正,采用EditSeq程序截取含有特定单核苷酸多态性(SNP)位点所在编码序列(CDS)区的DNA片段,采用MegAlign程序进行序列比对及单核苷酸和氨基酸多态性分析.结果 显示,25个测序成功的敏感虫株中,HCOI00378500基因所有核苷酸位点无差异;35个测序成功的耐药虫株中,有8个虫株出现了共32个SNP位点,并且导致17个氨基酸突变,其中突变率最高的SNP占8.6%(3/35).测序成功的40个耐药虫株中,HCOI00506600基因CDS区序列第75位碱基均发生突变(T>C);测序成功的21个敏感虫株中,有7个虫株发生突变(T>C);氨基酸由异亮氨酸(Ile,Ⅰ)变为苏氨酸(Thr,T).测序成功的38个敏感虫株中,HCOI01200700基因的38、101、125和134位点共有4个SNP;测序成功的13个耐药虫株中,32、48、71、86、101和131等5个位点共有6个SNP.HCOI01200700基因第38位呈G/A多态性(52.6%,20/38),第125位呈T/C多态性(57.9%,22/38),第134位呈C/A多态性(57.9%,22/38),敏感虫株基因中至少有1个38G、125T或134C,耐药虫株基因中均为38A、125C或134A.提示HCOI00506600基因可作为为捻转血矛线虫耐伊维菌素相关候选功能基因,HCO101200700基因可作为伊维菌素耐药性诊断的候选标记分子.

分类号： R383.19

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