基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张振超

作者： 张振超;陶美奇;潘永飞;孙国胜;王传友;安林海;戴忠良

作者机构：

关键词： 高通量测序;竞争性等位基因特异性PCR;指纹图谱;纯度鉴定;分子标记

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2025 年 39 卷 003 期

页码： 513-524

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为提高青花菜分子标记辅助育种水平，本研究基于高通量测序数据开发了70组KASP标记，并采用KASP检测平台对43份青花菜试验材料进行分型，根据分型结果筛选出分型效果好、多态性高的标记，用于指纹图谱构建、遗传关系确定和纯度鉴定。结果表明，70组KASP标记中，未分型成功有3个，未分型材料>5份有13个，多态性差的有6个，分型成功48个（成功率68.6%）。48个标记中，多态性信息含量（PIC）值≥0.30的标记有37个（占比77.08%），其中PIC值为0.37的标记数量最多，为11个，0.38的标记有3个。将48个标记的分型结果转化为二元编码数据，获得了43份青花菜育种材料的SNP-DNA指纹图谱。聚类分析结果发现，Br05与其他材料的遗传关系较远；Br12和Br19、Br33和Br34之间遗传系数均为100,Br14和Br32的遗传系数为99，表明两两间为同一株系的可能性大，这与在田间的表型观察结果基本一致。10组标记对30株Br19的一致性进行鉴定，发现纯度值区间为83.3%～96.7%，说明Br19株系间存在差异；采用10组标记对亲本Br19、Br35和杂交种F1(Br19×Br35)进行基因分型，结果有5个标记（SNP07、SNP09、SNP10、SNP11和SNP19）在三者间的分型结果不同，可用于杂交制种田F1(Br19×Br35)种子纯度鉴定。本研究结果对青花菜种质资源鉴定、分子标记辅助育种与新品种保护具有重要的应用价值。

分类号： S635.3

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