致胰腺泛黄鸭1型甲肝病毒全基因组分子特征
文献类型: 中文期刊
第一作者: 傅光华
作者: 傅光华;黄瑜;傅秋玲;程龙飞;万春和;施少华;陈红梅;林建生;林芳
作者机构:
关键词: 鸭1型甲肝病毒;胰腺炎;分子特征
期刊名称: 微生物学报
ISSN: 0001-6209
年卷期: 2014 年 54 卷 09 期
页码: 1082-1089
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】揭示致胰腺泛黄鸭1型甲肝病毒(duck hepatitis A virus 1,DHAV-1)全基因组的分子特征。【方法】运用RT-PCR技术,扩增出致胰腺泛黄DHAV-1 MPZJ1206株全基因组序列,并与鸭甲肝病毒参考毒株基因组序列进行比对分析。【结果】致胰腺泛黄DHAV-1 MPZJ1206株基因组全长为7703 nt,(G+C)%为43.05%,包含一个大的开放阅读框,编码2249个氨基酸残基的多聚蛋白,基因组结构与其他DHAV-1参考毒株一致。序列比对结果显示,MPZJ1206株全基因组序列与GenBank数据库中DHAV-1参考毒株核苷酸序列同源性在93.5%-99.6%之间,氨基酸同源性在97.9%-99.6%之间,遗传距离均低于7%;分子系统进化分析显示与2011年分离的2株DHAV-1(Du/CH/LGD/111238和Du/CH/LGD/111239)亲缘关系最近。【结论】尽管MPZJ1206毒株感染雏番鸭引起的临床病变与传统DHAV-1差异明显,但其基因组分子特征与传统的DHAV-1毒株相似,病毒致病型的改变可能与其组织嗜性改变相关。
分类号: S852.65
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