基于SCoT标记分析紫花苜蓿遗传多样性的取样数量(英文)

文献类型: 中文期刊

第一作者: 毛培

作者: 毛培;申书恒;蒲军;娄可可;周强;王增裕;孙娟;刘志鹏

作者机构:

关键词: 紫花苜蓿;SCoT标记;遗传多样性;取样数量

期刊名称: 草地学报

ISSN: 1007-0435

年卷期: 2022 年 05 期

页码: 1110-1121

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究采用目标起始密码子多态性(Start codon targeted, SCoT)标记,对600份不同紫花苜蓿(Medicago sativa L.)材料(共6个种质)的基因组DNA进行扩增,分析了不同取样数量下(10,15,20,30,40,50,60,70,80,90和100)紫花苜蓿的遗传多样性,旨在筛选出代表紫花苜蓿种群遗传多样性的最佳取样单株数。结果发现,6条SCoT引物共扩增出80个条带,平均每条引物的扩增条带数为13.3个,多态性条带百分率为100%。在评价不同取样梯度下的紫花苜蓿遗传多样性覆盖度时发现,当取样数量增加至40时,6个供试紫花苜蓿种质的遗传多样性覆盖率均达到95%以上。此外,本试验采用UPGMA与STRUCTURE聚类分析方法,分析了不同取样梯度下紫花苜蓿的遗传结构。结果表明,样本量为40时能够有效反映紫花苜蓿群体间差异。

分类号: S541.9

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