湖鲚体内与生长环境菌群PCR-DGGE指纹图谱及多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 聂志娟

作者： 聂志娟;徐钢春;程起群;杜富宽;张勇;顾若波;朱文龙

作者机构：

关键词： 湖鲚(Coilia ectenes taihuensis);PCR-DGGE;细菌群落;香农多样性指数

期刊名称： 淡水渔业

ISSN： 1000-6907

年卷期： 2015 年 01 期

页码： 8-14

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用PCR-DGGE技术,选择细菌原核通用引物F357-GC和R518对太湖湖鲚(Coilia ectenes taihuensis)鳃、肠壁及肠内容物及其生长环境菌群结构进行了初步分析。结果显示:PCR-DGGE指纹图谱分离显示49条清晰条带,样品菌群丰富度(DGGE条带数):湖水(33)>肠道壁(23)>湖泥(18)>肠道内容物(16)=鳃(16);相应的香农多样性指数分别为:3.11、2.76、2.21、2.37、2.30。湖鲚肠道壁、肠道内容物和鳃与湖水分别具有14、14、10条共有带,切胶回收测定其中21条优势条带,主要包含:变形菌(Proteobacteria)、放线菌(Actinobacteria)、拟杆菌(Bacteroidetes)、柔膜菌(Tenericutes)、蓝藻细菌(Cyanobacteria)、厚壁菌(Firmicutes)。结果表明PCR-DGGE指纹图谱能够清晰显示湖鲚不同部位及其生长环境细菌群落结构和区分其菌群结构差异,并阐明生长水域环境是影响湖鲚体内细菌菌群结构组成的主要因素之一。

分类号： S917.4

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