基于转录组测序的紫背天葵花青素相关基因分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张少平

作者： 张少平;张少华;邱珊莲;张帅;吴松海;何炎森;郑开斌;郑加协

作者机构：

关键词： 紫背天葵;转录组测序;功能注释;花青素基因

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 639-645

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为获取正常生长状态下紫背天葵花青素合成相关基因,本研究以全株紫背天葵为试验材料,采用高通量测序技术(Illumina Hi Seq 2500)对紫背天葵全转录功能基因组测序后组装,再通过GO、Swiss-Prot和NR三大数据库进行花青素相关功能基因筛选,共获得29个花青素相关Unigene,包括17个花青素相关糖基转移酶、3个花青素酰基转移酶、6个花青素相关还原酶以及3个无色花色素双加氧酶(合酶)。聚类分析研究表明,涉及到花青素合成相关的四类酶成员的29个Unigene中,花青素酰基转移酶家族内部之间亲缘关系最近,无色花色素双加氧酶次之,花青素相关还原酶亲缘关系稍远,而花青素相关糖基转移酶家族成员亲缘关系最远。本研究获取的29个紫背天葵花青素相关Unigene信息,为进一步研究紫背天葵花青素生物合成过程及基因克隆等奠定了理论基础。

分类号： S567.239

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