达氏鳇(Huso dauricus)生长激素基因挖掘及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 吕伟华

作者: 吕伟华;马波;尹家胜;徐伟;张颖

作者机构:

关键词: 达氏鳇(Huso dauricus Georgi);生长激素基因;基因挖掘;生物信息学

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN:

年卷期: 2020 年 010 期

页码: 4457-4466

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为进一步掌握生长激素(growth hormone,GH)基因在达氏鳇繁育、生长发育、基因多态性与生长性能相关性等方面的调控机制,本研究利用RACE扩增的方法获得了达氏鳇GH基因的全长cDNA序列掌握达氏鳇GH基因序列的组成结构特点并对GH蛋白进行了生物学信息分析。结果显示达氏鳇GH基因cDNA全长序列1 016 bp 5’非翻译区(5’-UTR)为125 bp,3’非翻译区(3’-UTR)为312 bp,包含30 bp的polyA尾巴,两个"AATAAA"加尾信号分别位于PloyA上游227 bp和19 bp处。利用推测的GH蛋白的氨基酸序列进行物种内的同源性比对分析达氏鳇与俄罗斯鲟的相似度最高,为97.94%;不同物种间的系统发育进化树显示达氏鳇与人、其他哺乳动物等聚为一大支,与施氏鲟聚一小支。达氏鳇GH蛋白的生物学信息分析结果显示:GH蛋白是由214个氨基酸组成含有信号肽、无跨膜结构的不稳定亲水性蛋白质,定位于细胞外,等电点为5.44,蛋白质二级结构中以α-螺旋和无规则蜷曲为主要元件,GH蛋白质含有15个丝氨酸(Ser)磷酸化位点,4个苏氨酸(Thr)磷酸化位点3个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点。本研究对达氏鳇生长基因GH进行了克隆,并对其进行了系统进化、蛋白理化性质、蛋白跨膜、蛋白亚细胞定位等研究,为今后深入了解GH基因在达氏鳇中的生物学功能提供理论基础。

分类号: S917.4

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