达氏鳇(Huso dauricus)生长激素基因挖掘及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 吕伟华
作者: 吕伟华;马波;尹家胜;徐伟;张颖
作者机构:
关键词: 达氏鳇(Huso dauricus Georgi);生长激素基因;基因挖掘;生物信息学
期刊名称: 基因组学与应用生物学
ISSN:
年卷期: 2020 年 010 期
页码: 4457-4466
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为进一步掌握生长激素(growth hormone,GH)基因在达氏鳇繁育、生长发育、基因多态性与生长性能相关性等方面的调控机制,本研究利用RACE扩增的方法获得了达氏鳇GH基因的全长cDNA序列掌握达氏鳇GH基因序列的组成结构特点并对GH蛋白进行了生物学信息分析。结果显示达氏鳇GH基因cDNA全长序列1 016 bp 5’非翻译区(5’-UTR)为125 bp,3’非翻译区(3’-UTR)为312 bp,包含30 bp的polyA尾巴,两个"AATAAA"加尾信号分别位于PloyA上游227 bp和19 bp处。利用推测的GH蛋白的氨基酸序列进行物种内的同源性比对分析达氏鳇与俄罗斯鲟的相似度最高,为97.94%;不同物种间的系统发育进化树显示达氏鳇与人、其他哺乳动物等聚为一大支,与施氏鲟聚一小支。达氏鳇GH蛋白的生物学信息分析结果显示:GH蛋白是由214个氨基酸组成含有信号肽、无跨膜结构的不稳定亲水性蛋白质,定位于细胞外,等电点为5.44,蛋白质二级结构中以α-螺旋和无规则蜷曲为主要元件,GH蛋白质含有15个丝氨酸(Ser)磷酸化位点,4个苏氨酸(Thr)磷酸化位点3个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点。本研究对达氏鳇生长基因GH进行了克隆,并对其进行了系统进化、蛋白理化性质、蛋白跨膜、蛋白亚细胞定位等研究,为今后深入了解GH基因在达氏鳇中的生物学功能提供理论基础。
分类号: S917.4
- 相关文献
[1]马鹿生长激素(GH)基因生物信息学预测及分析. 宋兴超,杨福合,刘汇涛,徐超,魏海军,邢秀梅. 2012
[2]豁眼鹅GH基因外显子2多态性与体重和体尺性状的关联分析. 张扬,陈阳,黄正洋,荣光辉,段修军,李欣钰,赵辉,徐琪,陈国宏. 2012
[3]适宜浓度的维生素E促进半滑舌鳎生长激素基因的表达. 王蔚芳,向玲,王琳,黄滨,李会涛. 2020
[4]转生长激素基因鲤鱼与正常鲤鱼经济性状的比较. 闫学春,孙效文,梁利群,曹顶臣. 2002
[5]五指山猪生长激素基因全序列克隆及序列分析. 林莉,欧江涛,郭春华,黄礼光,王希龙. 2007
[6]小型猪生长激素基因研究进展. 郑茂恩,潘登科,马月辉,叶绍辉,冯书堂. 2007
[7]蕨麻猪生长激素基因的克隆及多态性分析. 李军成,路彩霞,景志忠. 2010
[8]牦牛生长激素基因及其受体基因的PCR-SSCP研究. 阎萍,张森,梁春年,包鹏甲,曾玉峰,郭宪,裴杰,褚敏. 2010
[9]翘嘴鲌生长激素(GH)基因与侧翼区的克隆及分析. 刘士力,贾永义,蒋文枰,迟美丽,程顺,赵金良,顾志敏,傅建军. 2017
[10]大菱鲆生长激素基因cDNA的克隆、序列分析及分子系统研究. 刘滨,臧晓南,刘顺梅,张学成,雷霁霖. 2008
[11]清远麻鸡生长激素基因(GH)的SNPs检测及其对生长及繁殖性状的遗传效应. 束婧婷,张莹,尹平安,韩威,宋卫涛,邝智祥,李慧芳. 2011
[12]猪导入生长激素基因的整合表达和遗传. 范必勤. 1990
[13]猪羊生长激素基因保守性研究. 郑新民,华文君,乔宪凤,赵浩斌,李莉,曹军平,周荆荣,魏庆信. 2001
[14]转生长激素基因鲤的快速生长效应及传代. 孙效文,梁利群,闫学春,曹顶臣. 2002
[15]不同蛋白质源饲料中添加α-酮戊二酸对杂交鲟幼鱼肝脏谷氨酰胺含量、抗氧化能力及生长激素、胰岛素样生长因子-Ⅰ基因表达的影响. 王连生,徐奇友,陈迪,郑荣宁. 2016
[16]家禽生长激素GH基因的研究进展. 章玲玲,朱文奇,徐文娟,胡艳,宋卫涛,束靖婷,李慧芳. 2012
[17]五指山小型猪生长激素及其受体基因的克隆与序列分析. 李吉涛,牟玉莲,张莉,杨述林,李奎,冯书堂. 2006
[18]尼罗罗非鱼绿色荧光蛋白/GH融合表达载体的构建及其在NIH293T细胞中的表达. 王茂元,张平,邹芝英,李大宇,杨弘. 2011
[19]应用荧光原位杂交技术检测大麻哈鱼生长激素基因在超级鲤染色体上的插入位点. 耿波,梁利群,孙效文,曹鼎臣,闫学春. 2005
[20]羊生长激素基因的研究进展. 杨炜迪,李颖康. 2010
作者其他论文 更多>>
-
磁性二氧化硅复合材料制备及其对磺酰脲类除草剂的吸附研究
作者:张颖;叶宇航;司文帅
关键词:磁性二氧化硅复合材料;制备;表征;吸附;磺酰脲
-
秋季黑龙江茴鱼的年龄结构与生长特性
作者:韩豪祥;金洪宇;廉杰;薄永芳;马波
关键词:黑龙江流域;黑龙江茴鱼;年龄;生长
-
母体高尿酸血症对妊娠的影响及其表观遗传机制的研究进展
作者:张燠诗;范冰峰;张颖;许保增
关键词:高尿酸血症;妊娠;代谢综合征;表观遗传
-
西藏水生生物资源与环境本底状况调查(2017-2021)
作者:刘明典;朱峰跃;朱挺兵;李雷;王琳;刘香江;朱仁;刘飞;岑祥;胡飞飞;金星;袁立来;霍斌;何德奎;刘海平;徐玮彤;龚进玲;王鹏;丁放;杨瑞斌;张驰;杜红春;陈中祥;曹坤;扎西拉姆;刘绍平;段辛斌;杨德国;贾银涛;李应仁;李大鹏;马波;牟振波;陈大庆
关键词:鱼类资源;种类组成;优势种;环境;西藏
-
基于电子鼻的酿酒葡萄果实香气鉴定评价
作者:刘学伟;刘崇怀;樊秀彩;张颖;孙磊;黄丽亚;姜建福;牛生洋
关键词:电子鼻;酿酒葡萄;种质资源;香气
-
外源性雄激素17ɑ-甲基睾酮诱导性逆转过程中施氏鲟肝脏转录组的分析研究
作者:何铮;李禹韬;王若愚;曹顶臣;孙志鹏;王思涵;张依宁;张颖
关键词:17α-甲基睾酮;性腺组织学;类固醇激素;转录组测序
-
河北奶牛养殖加工一体化发展现状及政策分析
作者:赵慧秋;谷粟琨;李志佳;赵善江;顾文源;马志愤;魏玉东;韩燕;董飞;徐伟;马修国
关键词:河北省;奶牛养殖;乳制品加工;一体化发展