牛Trf2基因的cDNA克隆和生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 淮亚红

作者： 淮亚红;许尚忠

作者机构：

关键词： Trf2;牛;RT-PCR;组织表达

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2009 年 37 卷 18 期

页码： 91-94

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]探讨牛Trf2基因的生物学功能,为进一步研究该基因对牛精液品质的影响奠定基础。[方法]以牛睾丸组织为材料,根据GenBank中发表的人Trf2基因序列,结合生物信息学技术,设计并合成3对引物,采用RT-PCR方法克隆牛Trf2cDNA,并运用DNA-MAN软件及在线工具对所得到的序列进行生物信息学分析。采用牛肾脏、肝脏、睾丸、肺、瘤胃、子宫、小肠、心脏、脾脏、卵巢和脂肪组织共11个组织,以牛-βactin基因为内参基因,对牛Trf2基因的组织表达谱进行分析。[结果]牛Trf2基因cDNA长度为1 701 bp(Gen-Bank登录号EU140625),包含由561个碱基组成的开放读码框(ORF),该ORF包含1个UGA终止密码子,编码186个氨基酸;在进化关系上,牛首先和人、大鼠、狗聚成一类,然后与袋鼠聚成第1群,再与小鼠聚成第2群。Trf 2蛋白含有2个结构域TLF和SPT15。牛Trf2基因在各个组织中都有表达,在睾丸组织中表达最高。[结论]获得了牛Trf2基因的cDNA序列(GenBank登录号EU140625);牛Trf 2蛋白可能对牛精液品质有影响。

分类号： S823

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