基于SLAF-Seq技术的橄榄种质资源SNP标记开发与遗传关系鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 沈朝贵

作者： 沈朝贵;赖瑞联;陈瑾;冯新;陈义挺;韦晓霞;吴如健

作者机构：

关键词： 橄榄;种质资源;SNP标记;遗传结构;遗传多样性

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2024 年 005 期

页码： 557-562

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】开发橄榄SNP标记并分析其种质资源遗传多样性，为橄榄种质资源保护和利用提供依据。【方法】基于SLAF-Seq技术进行橄榄SNP标记开发，同时采用系统进化分析、群体聚类分析和主成分分析等研究了橄榄种质资源遗传结构和遗传多样性。【结果】基于SLAF-Seq技术共挖掘到506 701个SLAF标签，其中多态性SLAF标签27 108个，开发获得361 386个群体SNP标记；基于SNP标记，利用系统进化树和群体聚类分析可分别将橄榄种质资源分为3和6个类群，整体Nei多样性指数和Shanon-Wiener指数分别为0.321和0.472。两种分类方法分析结果均发现，不同地区之间的橄榄种质资源并未严格按照地域分布归类。【结论】橄榄种质资源遗传多样性相对丰富，且不同地域间存在种质资源交流，而采用SNP标记可有效鉴定橄榄种质资源。

分类号： S667.5

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