基于DNA条形码基因和核基因的美丽小条鳅隐存多样性研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 高尚

作者： 高尚;向登高;李跃飞;李捷;陈蔚涛

作者机构：

关键词： 美丽小条鳅（Micronemacheilus pulcher）;DNA条形码;COI;Glyt;隐存种

期刊名称： 淡水渔业

ISSN： 1000-6907

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 3-11

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为揭示华南地区美丽小条鳅（Micronemacheilus pulcher）的隐存多样性及其地理分布格局，同时为美丽小条鳅的精准管理和保护提供重要理论背景知识，本研究采集了华南地区多个水系19个地理群体共计102尾美丽小条鳅样本，测定了所有样本的DNA条形码标准基因（线粒体COI基因）与部分样本的糖基转移酶基因（Glyt基因）,综合了系统发育分析、遗传距离估算、等位基因网状图分析、物种有效性界定等方法，基于COI基因的系统发育结果显示，美丽小条鳅存在两个主要谱系（I和Ⅱ）,谱系Ⅰ主要由珠江水系、漠阳江水系、南流江水系群体构成，谱系Ⅱ由海南岛的陵水河水系和南渡江水系群体组成。另外，研究发现谱系Ⅰ可以细分为三个严格地理分布的子谱系（Ⅰ-1,Ⅰ-2和Ⅰ-3）,其中子谱系Ⅰ-1由珠江水系的西江、北江和南流江水系的群体组成，子谱系Ⅰ-2和Ⅰ-3分别由珠江水系的东江群体和漠阳江水系群体组成；谱系Ⅱ可以分为子谱系Ⅱ-1和Ⅱ-2,分别由陵水河水系群体和南渡江水系群体组成。遗传距离估算发现谱系Ⅰ和Ⅱ之间的遗传距离达到5.83%,谱系Ⅱ的两个子谱系之间的遗传距离到达2.92%,大于2%的DNA条形码物种鉴定阈值。基于Glyt基因的系统发育分析未获得严格的谱系分化，但是等位基因网状图支持大陆群体和海南岛群体以及海南岛的陵水河水系群体和南渡江水系群体的进化独立性。基于COI基因的ABGD（automatic barcode gap discovery）和PTP（poisson tree process）分析和联合两个基因的BPP（bayesian phylogenetics and phylogeography）分析均支持谱系Ⅰ、子谱系Ⅱ-1和子谱系Ⅱ-2为三个独立物种，表明美丽小条鳅至少包含三个隐存种。研究结果表明美丽小条鳅的多样性可能被低估，亟需使用形态度量学、更高覆盖度的和多种类型的分子标记来全面系统揭示其隐藏的遗传多样性，为美丽小条鳅全面精准的管理保护提供数据支持。

分类号： S917.4

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