基于COI条形码的根口水母科Rhizostomatidae水母分子系统进化研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李玉龙

作者： 李玉龙;王彬;孙明;王小林;于旭光;李轶平;付杰;王文波;董婧

作者机构：

关键词： DNA条形码;COI基因;根口水母科;系统分析

期刊名称： 大连海洋大学学报

ISSN： 2095-1388

年卷期： 2017 年 32 卷 05 期

页码： 520-525

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨DNA条形码基因COI序列在根口水母科Rhizostomatidae水母物种鉴定中的有效性,分析了根口水母科3属6种水母及口冠水母科1属1种共计265条线粒体COI基因同源序列,利用MEGA 3.0计算根口水母科种内与种间的遗传距离,并基于邻接法(Neibour-Joining,NJ)、最大似然法(Maximum Likelihood,ML)和贝叶斯法(Bayesian,BI)构建了其分子系统进化树。结果表明:4个属7种水母种类COI基因同源序列长度为482 bp,种间遗传距离为0.065~0.235,平均遗传距离为0.198,种内遗传距离为0~0.032,平均为0.006,其中种间平均遗传距离(0.198)显著大于种内平均遗传距离(0.006),种间遗传距离是种内遗传距离的33倍;根口水母科水母种间遗传距离均大于Hebert推荐区分物种的最小种间遗传距离(0.02);采用NJ法、ML法和BI法构建的分子系统树拓扑结构基本一致,同一物种不同个体间均能聚成独立的单系群,表明COI基因可作为根口水母科水母种类准确鉴定的有效条形码基因;系统进化树显示,海蜇属为单系群,系统进化分析结果与形态分类学的观点并不十分一致。研究表明,COI基因序列在根口水母科不同阶元间变异较大,适合于根口水母科水母种类鉴定及群体水平的分子标记。

分类号： S917.4

  • 相关文献

[1]动物DNA条形码鉴定技术及其在害虫种类鉴定中的应用. 张莉,苏生,吕召云,孟泽洪. 2014

[2]基于线粒体COI基因序列的5种鲤养殖品种遗传多样性研究. 单云晶,鲁翠云,李超,张明昭,顾颖,孙效文. 2013

[3]一种紫芝重要害虫-台湾斑谷蛾. 徐淼锋,廖永林,林伟,刘若思. 2022

[4]中国近海习见头足类DNA条形码及其分子系统进化. 王鹤,林琳,柳淑芳,姜志强,庄志猛. 2011

[5]基于DNA条形码研究中国枪乌贼和鸢乌贼的食物种类组成. 刘梦娜,徐磊,王雪辉,刘玉,王淼娣,邱永松,朱江峰,何映霖,贝伟烈,杜飞雁. 2020

[6]南极鱼亚目鱼类DNA条形码及分子系统学. 姜郦轩,张吉昌,樊钢洲,李昂,柳淑芳,庄志猛. 2021

[7]DNA条形码技术鉴别市售鱼肉制品真伪. 石蕊寒,南汇珠,丁红田,王建昌,付琦,孙晓霞,王金凤,丁丽丽,崔景芳,刘洋,郭春海. 2018

[8]DNA条形码在鲱形目鱼类物种鉴定和系统进化分析中的应用. 李献儒,柳淑芳,李达,杜腾飞,庄志猛. 2015

[9]线粒体COI基因条形码在鲿科鱼类物种鉴定中的应用. 梁宏伟,孟彦,罗相忠,李忠,邹桂伟. 2018

[10]基于COI基因5'端与3'端序列田间常见粉虱的分子鉴定. 田虎,张金良,张桂芬,陈苗苗,万方浩. 2014

[11]DNA条形码技术在鲻科鱼类鉴定中的应用. 刘璐,孙典荣,李纯厚,韩志强,高天翔,宋娜. 2016

[12]DNA条形码技术在桃蚜寄生蜂鉴定上的应用. 孙星星,陈永成,王凡,蒋颖洁,王凯,胡积祥,高波,李红阳,顾慧玲,张礼生. 2024

[13]高寒山地食物保障的影响因子分析. 尼玛扎西. 2000

[14]农村庭院立体农业开发研究. 朱保本,吴跃芳. 1994

[15]中国转型期土地权属纠纷:系统分析与文化对策. 胡勇,陈利根. 2010

[16]农村能源生态工程建设模式设计与分析. 董维荣,田军,姜自斌. 1996

[17]新疆塔里木盆地盐碱土综合治理与水资源合理分配规划模型研究. 黄运祥,何建坤. 1990

[18]北京市种业发展政策的系统分析与转型创新. 刘晴,卢凤君,李志军,谢莉娇,赵淑红,张伟,张怀波. 2015

[19]全国土地管理信息系统的系统分析和总体设计研究. 寇有观,萧术. 1999

[20]SRAP分子标记分析体系的建立及白簕资源亲缘关系分析. 林春华,李兆龙,乔燕春,林伟君,刘自珠,谭雪. 2012

作者其他论文 更多>>

微信小程序