冠菌素诱导橡胶树次生乳管分化的形成层细胞CUT&Tag文库构建和初步分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张世鑫

作者： 张世鑫;葛立鑫;吴绍华;晁金泉;杨署光;史敏晶;张华;田维敏

作者机构：

关键词： 巴西橡胶树;次生乳管分化;维管形成层;原生质体;组蛋白乙酰化;CUT&Tag

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2024 年 45 卷 010 期

页码： 2010-2024

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： CUT&Tag 技术是一种研究蛋白质-DNA 互作的新方法,使用超高活性的新型 pG-Tn5 转座酶,在抗体引导下精准靶向切割目的蛋白附近的DNA序列,从而进行cDNA建库和测序分析.此技术在人类和动物研究中应用广泛,由于植物细胞结构特殊,该技术在植物研究中应用较少.在前期研究中,我们发现组蛋白乙酰化修饰参与茉莉酸诱导橡胶树次生乳管分化的调控,但其分子机制尚未阐明.本研究利用冠菌素(COR)诱导橡胶树萌条维管形成层分化次生乳管的实验系统,通过酶解法获取高质量的形成层区细胞原生质体,使用组蛋白H3 乙酰化修饰抗体对次生乳管分化过程中发生组蛋白乙酰化修饰的区域进行原位识别,采用CUT&Tag技术成功构建COR处理橡胶树树皮形成层细胞的cDNA文库.对构建cDNA文库进行质检和测序分析,发现文库质量较好,并通过差异基因的GO和KEGG富集分析,发现生长素、类黄酮代谢和蛋白质泛素化等相关基因得到富集.本研究结果为使用 CUT&Tag 技术构建植物组织的cDNA文库提供操作方法,为解析组蛋白乙酰化修饰调控橡胶树次生乳管分化的分子机制提供理论基础.

分类号： S576%S59

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