小反刍兽疫病毒FY株全基因组序列的测定及其分子特征的研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘柱

作者： 刘柱;缪秋红;李琦;宫晓华;李传峰

作者机构：

关键词： 小反刍兽疫病毒;PPRV-FY株;全基因组;序列分析

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2017 年 01 期

页码： 38-46

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据小反刍兽疫病毒(PPRV)参考序列设计了11对特异性引物,然后用RT-PCR方法分段扩增出PPRV富阳分离株(PPRV-FY)的全基因组序列,用DNAstar软件和Mega软件对PPRV-FY株及参考毒株的基因序列进行了比对和分析,并根据N基因核苷酸序列绘制了系统进化树。结果,PPRV-FY株全长15 948 bp,编码6种结构蛋白(N、P、L、M、F和H),2种非结构蛋白(C和V),PPRV各毒株转录起始序列和转录终止序列都高度保守。同源性分析结果表明,PPRV-FY株与PPRV-Coted′Ⅰvoire89同源性最低,为89.0%,与PPRV/Tibet/30/2007株和PPRV/Tibet/2007株的同源性最高,为97.3%,其基因间隔区N-P长度一致,相似度最高,而M-F相似度最低。通过比较PPRV-FY株与参考毒株基因组末端调控序列,可以看出整个麻疹病毒属GP区和AGP区保守性较高,且存在不同程度的互补。氨基酸序列分析结果表明,PPRV-FY株在保守区域出现21处氨基酸突变,这些突变对其所编码蛋白的结构和功能有何影响尚需要进一步研究。此外,本文还基于N基因序列,对PPRV-FY株及参考毒株进行了系统进化分析。结果表明,PPRV-FY株与其它亚洲源PPRV野毒株共同形成一个拓扑群,属于第IV谱系。

分类号： S852.65

  • 相关文献

[1]Ⅰ型鸭肝炎病毒A66弱毒株全基因组分子克隆及序列分析. 黄显明,张小飞,魏建忠,李春芬,廖俊伟,毛火云. 2009

[2]犬细小病毒JL-M13株分离鉴定及全基因组序列分析. 仝明薇,易立,程世鹏,孙长英,王文宪. 2014

[3]森林草莓全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析. 苗立祥,张豫超,杨肖芳,蒋桂华. 2012

[4]猪传染性胃肠炎病毒分离株JS2012全基因组序列分析. 郭容利,李彬,范宝超,温立斌,茅爱华,周萍,何孔旺. 2016

[5]鸭甲肝病毒GX株全基因组序列测定及VP1蛋白生物信息学分析. 黄云秀,李传峰,孟春春,陈宗艳,李露,宋凯杰,刘光清,韦天超. 2015

[6]猪圆环病毒2型滨州分离株全基因组的克隆与序列分析. 张文通,李峰,魏凤,苗立中,吴家强,沈志强. 2015

[7]大白菜WRKY转录因子的全基因组鉴定与分析. 蒋明,苗立祥,张豫超,管铭,潘小翠. 2013

[8]1型鸭肝炎病毒E53株和HP-1株全基因组序列分析. 陈晓丹,张云,王钰,郭冬春,李永锋. 2009

[9]甜瓜全基因组WRKY转录因子基因的鉴定与分析. 苗立祥,蒋明,李建波,寿森炎. 2014

[10]鹅细小病毒弱毒株的培育及其致弱前后全基因组中核酸变异的分析. 张青山,李晨曦,刘明,邵周伍林,张云. 2016

[11]鸭坦布苏病毒AH-F10株全基因组的分子克隆与序列分析. 王楠楠,姜安安,王蓓,王晓旭,毕庄莉,唐井玉,刘光清,王桂军. 2014

[12]犬瘟热病毒AH株全基因组序列测定及其分子特征. 刘柱,李丹丹,李琦,宫晓华,缪秋红,李传峰,陈宗艳,张淼涛,刘光清. 2017

[13]2株H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列测定及遗传性分析. 沈佳,章振华,姜北宇,李林,景小冬,张建伟. 2011

[14]猪繁殖与呼吸综合征病毒流行株Jiangxi-3的全基因组序列分析. 王旭荣,张彩勤,赵炳武,张春红,杨增岐,宋长绪. 2009

[15]猪圆环病毒2型吉林分离株全基因组的克隆与序列分析. 杨博超,王凤雪,温永俊,李建喜,杨志强,武华. 2013

[16]2株H9N2亚型禽流感病毒全基因组序列测定及遗传性分析(英文). 沈佳,章振华,姜北宇,李林,景小冬,张建伟. 2011

[17]马铃薯帚顶病毒基因组克隆与侵染性克隆构建. 刘野,高艳玲,刘佳慧,方月,马廷帅,毛彦芝,张丽莉,白艳菊,程晓非. 2022

[18]猪源乙型脑炎病毒HEN0701株全基因组的分子特征. 郑浩,孙春清,袁世山. 2011

[19]猪圆环病毒2型山西株全基因组序列分析. 孟帆,吴忻,姚敬明,樊振华,刘文俊,王娟萍,韩一超,薛翼鹏,米瑞娟,李玉斌. 2016

[20]鸡传染性支气管炎病毒分离株CK/CH/HD/171018的生物学特性及其全基因组序列分析. 李智超,王友令,徐腾飞,栗永华,车路平,刘盼娆,仇旭升,孙英杰,谭磊,廖瑛,宋翠萍,丁铲,姚刚,孟春春,王金泉. 2018

作者其他论文 更多>>

微信小程序