丝瓜WRKY转录因子基因的分离与褐变分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘建汀

作者： 刘建汀;朱海生;温庆放;王彬;张前荣;陈敏氡;林珲;薛珠政

作者机构：

关键词： 丝瓜;转录组测序(RNA-seq);褐变;WRKY;表达分析

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2017 年 12 期

页码： 1950-1960

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： WRKY转录因子是一类发现于高等植物中的转录因子超家族。许多研究表明,WRKY转录因子在植物生物和非生物胁迫中起作用,但是这些研究主要集中在拟南芥(Arabidopsis thaliana)等模式植物中,在甜瓜(Cucumis melo)及辣椒(Capsicum annuum)等蔬菜作物中也有报道,而丝瓜(Luffa cylindrical)WRKY转录因子在褐变中的研究还未见相关报道。前期利用转录组测序(RNA-seq)技术获得了鲜切丝瓜福丝3号果肉褐变前后转录组数据库,本研究从中筛选得到4个与植物WRKY转录因子蛋白一致性较高的Unigene序列。分析发现,4个丝瓜WRKY基因Unigene0018509、Unigene0021412、Unigene0025291和Unigene0034271均含1个完整的开放读码框(ORF),序列全长分别为2 189、1 990、2 365和2 274 bp,Gen Bank登录号为:KY621843~KY621846。Wolf Psort预测显示,4个Unigene编码的WRKY蛋白均定位于细胞核中。系统进化和基因保守结构域分析表明,4个WRKY转录因子均含有1个保守的WRKY结构域,且锌指结构为C2H2型,属于第(6)类WRKY蛋白家族。利用定量PCR技术分析了4个WRKY基因在丝瓜'福丝3号'不同组织(根、茎、叶、花和果肉)以及采后不同储藏时间下的表达情况,对4个WRKY基因在鲜切丝瓜果肉不同时间的表达模式与RNA-seq结果进行了分析。结果表明,4个丝瓜WRKY基因均具有组织表达特异性,且表达模式各不相同。4个WRKY基因在鲜切后q-PCR表达值与RNA-seq得到的表达量(fragments per kilobase million,FPKM)变化趋势基本一致,WRKY基因Unigene0018509、Unigene0021412和Unigene0025291在丝瓜鲜切后0~6 h内的表达量呈显著上调(P<0.05),Unigene0034271在0~3 h内上调表达,6 h出现下调表达。分析发现,4个WRKY基因在丝瓜采后不同储藏褐变时间内的表达趋势总体上调,但4个WRKY基因的表达模式不尽相同。该研究为进一步阐明丝瓜褐变调节机理和品种的选育提供理论依据。

分类号： Q943.2`S642.4

  • 相关文献

[1]丝瓜多酚氧化酶PPO基因家族的克隆与表达分析. 朱海生,康娟,刘建汀,陈敏氡,李永平,王彬,林碧英,温庆放. 2018

[2]丝瓜铜锌超氧化物歧化酶Cu/Zn-SOD基因家族的克隆与表达分析. 朱海生,刘建汀,陈敏氡,李永平,王彬,张前荣,叶新如,林珲,温庆放. 2017

[3]丝瓜苯丙氨酸解氨酶基因PAL克隆及表达分析. 朱海生,温文旭,刘建汀,叶新如,陈敏氡,王彬,张前荣,李永平,温庆放. 2018

[4]不同丝瓜品种褐变相关基因的表达分析. 冯英娜,王冉,王媛花,苏小俊,张更,颜志明. 2020

[5]丝瓜过氧化氢酶基因CAT1的克隆及表达分析. 温庆放,刘建汀,朱海生,陈敏氡,王彬,张前荣. 2016

[6]丝瓜过氧化物酶基因的克隆及其在果实褐变中的表达分析. 朱海生,刘建汀,王彬,陈敏氡,张前荣,叶新如,林珲,李永平,温庆放. 2018

[7]桃WRKY基因家族全基因组鉴定和表达分析. 谷彦冰,冀志蕊,迟福梅,乔壮,徐成楠,张俊祥,周宗山,董庆龙. 2016

[8]大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析. 隋淑梅,黄思杰,田洁. 2023

[9]葡萄全基因组WRKY转录因子鉴定和分析. 苏玲,王鹏飞,杨阳,任凤山,王咏梅,陈万钧. 2019

[10]铝胁迫下金沙柚3个WRKY基因的生物信息学与表达分析. 刘召亮,万水林,闫承璞,王雨亭,胡钟东. 2019

[11]丝瓜LcWRKY21转录因子基因的克隆与表达分析. 刘建汀,朱海生,温庆放,王彬,张前荣,陈敏氡,林珲,薛珠政. 2017

[12]丝瓜多聚泛素基因(LcUBQ)的克隆及表达分析. 陈敏氡,王彬,朱海生,温庆放. 2018

[13]基于转录组测序的大口黑鲈驯食相关SNP开发及其与生长性状的关联分析. 马冬梅,全迎春,樊佳佳,胡婕,白俊杰,刘浩. 2018

[14]大口黑鲈转录组SNPs筛选及其与生长的关联分析. 全迎春,马冬梅,白俊杰,刘浩,李胜杰,刘海涌. 2016

[15]WRKY35转录因子的cDNA克隆与植物表达载体的构建. 伍林涛,杜才富,邵明波. 2010

[16]WRKY转录调控因子在植物与病原体互作中的功能. 伍林涛,万谦,韩宏仕,奉斌,康公平,曾章丽. 2014

[17]农作物旱胁迫响应相关转录因子的研究进展. 巩檑,石磊,宋玉霞,陈虞超,甘晓燕,张丽,李苗. 2013

[18]五个WRKY转录因子在水稻叶片生长和抗病反应中的表达研究. 缪刘杨,李莉云,刘钊,刘雨萌. 2013

[19]中间锦鸡儿WRKY蛋白与豆科等植物同源蛋白的比较分析. 万永青,万东莉,柳金华,王瑞刚,李国婧. 2019

[20]甜高粱WRKY转录因子基因的克隆与表达分析. 徐磊,胡小文,姚艳丽,邢淑莲,刘洋. 2017

作者其他论文 更多>>

微信小程序