黄瓜AP2/ERF基因家族全基因组鉴定及表达模式分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨巍

作者： 杨巍;赵丽芬;杨娟;李飞;王天文;邓英

作者机构：

关键词： 黄瓜;AP2/ERF转录因子;生物信息学;表达模式

期刊名称： 云南农业大学学报

ISSN： 1004-390X

年卷期： 2024 年 39 卷 005 期

页码： 127-143

收录情况： CSCD

摘要： [目的]在黄瓜全基因组中鉴定APETALA2/ethylene responsive factor(AP2/ERF)基因家族,分析其基因结构与功能及表达模式,为该家族基因在黄瓜生长发育及抵御逆境胁迫中的作用提供参考.[方法]利用生物信息学对CsaAP2/ERF家族进行鉴定,并分析该家族成员的理化性质、结构与功能、蛋白互作关系、进化关系和表达模式.[结果]黄瓜全基因组中鉴定出 148个AP2/ERF家族成员,根据同源性分为 5个亚族:AP2、ERF、DREB、RAV和Soloist,各亚族成员的基因结构与保守基序相似.CsaAP2-11和CsaAP2-15是蛋白互作网络的核心蛋白,与多个蛋白质存在互作关系.共线性分析显示:CsaAP2/ERF与南瓜同源基因进化关系最为相近.在逆境胁迫(冷、热、盐)下,CsaAP2-15、CsaAP2-18、CsaERF-31、CsaERF-54、CsaERF-64、CsaERF-65、CsaDERB-37、CsaDREB-38、CsaDREB-45等基因的表达量发生显著变化.[结论]本研究对黄瓜AP2/ERF家族成员进行系统鉴定和特征分析,并分析了其在多种胁迫下的表达模式,为该家族基因的生物学功能研究与培育抗逆黄瓜新品种提供了理论基础.

分类号： S642.201

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