白掌SSR引物筛选及12份种质资源亲缘关系分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘小飞

作者： 刘小飞;孙映波;黄丽丽;于波

作者机构：

关键词： 白掌;简单重复序列;指纹图谱编码;种质资源

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 020 期

页码： 6802-6810

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究比较分析了白掌Spathiphyllumn'Parrish'转录组和叶绿体基因组中SSR标记的类型与分布,结果发现转录组中共有SSR标记7 184个,其中,二核苷酸重复数量最多,为3 454个;叶绿体基因组共有SSR标记281个,其中,单核苷酸重复数量最多,为223个.分别从转录组和叶绿体基因组的SSR标记中随机挑选32和18个,设计引物,PCR扩增后琼脂糖电泳结果显示,来自转录组的24对引物扩增条带清晰,多态性好;来自叶绿体基因组16对引物扩增条带清晰,多态性差.因此,选择来自转录组的24对引物合成M13标记的荧光引物,PCR扩增后毛细管电泳结果显示,19对引物共扩增出60个等位位点.利用60个等位位点构建了 12份种质资源的系统进化树,UPGMA聚类分析将12份种质分为3组.19对引物中DN9090、24-DN9534、27-DN9108和DN10117 4对引物多态性较好,分别扩增出4、6、4和6个等位位点,可完全区分12份种质.本研究将为白掌种质资源鉴评提供可靠的SSR荧光标记引物.

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