2个尼罗罗非鱼群体GHSR基因5'侧翼序列的多态性及其遗传多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王春晓

作者： 王春晓;高风英;卢迈新;刘志刚;朱华平;叶星

作者机构：

关键词： 尼罗罗非鱼;GHSR基因;5'侧翼区;多态性;遗传多样性

期刊名称： 南方水产科学

ISSN： 2095-0780

年卷期： 2015 年 11 卷 01 期

页码： 18-25

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 该试验以快长尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)和普通尼罗罗非鱼2个群体为研究对象,通过PCR扩增与测序,获得GHSR基因5'侧翼区序列77条,片段大小为1 217 bp。共检测出变异位点57个,包括12个插入/缺失位点和45个多态性位点。共发现16种单倍型,其中Hap2可能为原始单倍型。16种单倍型在进化树中聚为A和B 2支,A支中有11种单倍型,在普通群体和快长群体中均有分布,但快长群体中所占比例较高;B支中有5种单倍型,均分布于普通群体中。遗传多样性参数显示普通尼罗罗非鱼群体的核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸差异数(K)都高于快长尼罗罗非鱼群体。AMOVA分析结果显示快长和普通尼罗罗非鱼2个群体之间的Fst为-0.200 0(P>0.1),表明2个群体间遗传分化不明显,且2个群体的遗传差异主要来自群体内(120%)。

分类号： S917.4

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