黄秋葵果实转录组测序及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李和平

作者： 李和平;姚运法;练冬梅;赖正锋;洪建基

作者机构：

关键词： 黄秋葵;果实;RNA-Seq技术;SSR标记

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2018 年 03 期

页码： 121-127

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究黄秋葵果实转录组中功能基因的表达情况,采用RNA-Seq技术对3份黄秋葵果实进行测序分析。结果显示,3份测序材料组装后共获得了77 476个Unigene序列,有61 891个Unigene在4大数据库中得到注释,占79.88%;以KEGG代谢途径数据库为依据,可将13 336个黄秋葵果实的Unigene分成128个代谢途径;在黄秋葵果实转录组中发现3 830个SSR(Simple Sequence Repeats)位点,分布在3 569条Unigenes中,发生频率为4.61%。

分类号： Q943.2`S649

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