金线莲ArLBD1基因克隆、亚细胞定位及表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 林江波
作者: 林江波;黄惠明;邹晖;李和平;戴艺民
作者机构:
关键词: 金线莲;ArLBD1;亚细胞定位;基因克隆;原核表达
期刊名称: 北方园艺
ISSN:
年卷期: 2024 年 001 期
页码: 100-106
收录情况: 北大核心
摘要: 以金线莲(Anoectochilus roxburghii)叶片的转录组数据为基础,采用RT-PCR技术克隆到了金线莲ArLBD1转录因子基因,采用生物信息学、原核表达、Western blot、亚细胞定位及qPCR等方法对该基因功能进行初步分析,以期为进一步研究其功能提供参考依据。结果表明:ArLBD1基因CDS长度864 bp,编码287个氨基酸。ArLBD1蛋白分子量为30.62 kD,理论等电点为6.25,不稳定系数55.55,属于不稳定蛋白。ArLBD1蛋白含有LOB superfamily保守结构域,第7~28氨基酸为C基序,第36~84氨基酸为GAS基序,第89~107氨基酸为类亮氨酸拉链基序,具有完整的类亮氨酸拉链基序,属于ClassⅠ。系统进化分析表明ArLBD1与拟南芥AtLBD36的亲缘关系最近,其次是AtLBD6。SDS-PAGE电泳及Western blot结果显示,ArLBD1基因在大肠杆菌中成功诱导表达。亚细胞定位分析发现ArLBD1蛋白定位在细胞核。qPCR分析结果表明,ArLBD1基因在金线莲叶、茎和根中都能检测到表达,在叶片表达量最高,其次是根,茎的表达量最低,推测ArLBD1基因主要在金线莲叶片发育中发挥功能。
分类号: S567.239
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