辣椒抗黄瓜花叶病毒同源序列的克隆与分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 杨学玲
作者: 杨学玲;王述彬;刘金兵;潘宝贵;万红建;陈劲枫
作者机构:
关键词: 辣椒;黄瓜花叶病毒;抗病基因同源序列;核苷酸结合位点-富含亮氨酸重复
期刊名称: 江苏农业学报
ISSN: 1000-4440
年卷期: 2009 年 25 卷 04 期
页码: 124-128
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 根据已知抗病基因的核苷酸结合位点(NBS)保守结构域设计简并引物,以高抗黄瓜花叶病毒的辣椒Yv2007001为试材,获得10条抗病基因同源序列(RGA)。经序列分析,这些RGAs皆具有开放阅读框和NBS保守结构域(P-loop、Kinase-2、Kinase-3a、RNBS-C和GLPL),属于nonTIR-NBS-LRR类抗病基因同源序列。其中RGA46与番茄花叶病毒抗性基因Tm-22的氨基酸同源性为78%,可能与辣椒抗黄瓜花叶病毒(CMV)相关。其它序列与已知抗病基因Prf、RPP13、I2C-1、Mi-1.2、L6、M氨基酸相似性为21%~70%。所得RGA序列的Ka/Ks值为0.0110~0.3051,均显著小于1,表明"纯化选择"在辣椒NBS区域进化中起主要作用。
分类号: S436.418
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