口蹄疫病毒强毒株China/99P2区核苷酸序列测定及比较分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张显升

作者: 张显升;赵启祖;刘在新;江鹏斐;常惠芸;陈应理;李冬;魏怀录;谢庆阁

作者机构:

关键词: 口蹄疫病毒;China/99P2区;核苷酸序列;比较分析

期刊名称: 畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2002 年 33 卷 5 期

页码: 496-500

收录情况: CSCD

摘要: 以口蹄疫病毒强毒株China/99PNA为反转录模板,用一对特异性引物扩增目的cDNA,然后与pGEM-T Easy载体连接并转化J109菌株,再经重组质粒电泳、PCR和EcoR1酶切鉴定,序列测定和分析结果表明,该强毒株与A12、O1K和TW45毒株的核苷酸差异率分别为7.78%、6.62% 13.19%,推导的氨基酸序列差异率分别为1.23%、1.84%和5.73%,4个毒株序列比较发现,China/99、O1K和TW45三毒株的2A/2B连接处为甘氨酸/脯氨酸,A12为精氨酸/脯氨酸,而且T-C转换率和A-G转换率较高,是点突变的热点核苷酸,氨基酸差异主要存在于2B和2C蛋白中,2A基因较为保守,2B蛋白和第1-4,63-67,73-78,83-91,116-121和126-131区域,2A蛋白的第4-9区域和2C蛋白的第9-13,22-25,91-96,150-159,179-188,201-207和258-262区域可能是重要的活性中心。

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