基于全长cDNA序列的小麦cSNP发掘

文献类型： 中文期刊

第一作者： 毛新国

作者： 毛新国;汤继凤;周荣华;景蕊莲;贾继增

作者机构：

关键词： 单核苷酸多态性;基因组供体;转换;颠换;单体型

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2006 年 32 卷 12 期

页码： 1836-1840

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以测序得到的来自小麦不同基因组的基因序列为源序列,用AutoSNP软件,在GenBank中的小麦EST库中检测到一批cSNP,开辟了一条发掘小麦基因组特异候选cSNP的新途径。在2089个源序列中,检测到1296个cSNP,其中有397个来自A基因组,322个来自S基因组,420个来自D基因组;另外,A和D基因组共有的SNP有154个,A和S,S和D,A、S和D基因组共有的SNP各仅有1个,这一结果也同时表明,小麦的3个基因组供体种中,A、D基因组关系比较近,而它们与S基因组的关系比较远。统计分析表明,小麦中SNP出现的频率约为0.914‰。

分类号： S512.1

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