尾分析法在不同规模群体中开展全基因组关联研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 武群清

作者： 武群清;张龙超;黄生强;王立贤

作者机构：

关键词： 尾分析法;全基因组关联分析;遗传力;选择比例

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2017 年 07 期

页码： 1181-1190

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在将尾分析法与全基因组关联分析相结合,初步确定两尾选择的标准。首先,对样本量为2 000、1 500、1 000、500的群体进行全基因组关联分析(GWAS),探索群体规模大小对GWAS结果的影响,然后对各样本量两尾的20%、15%、12%、10%、8%、5%进行GWAS,探索两尾比例的大小对GWAS结果的影响。研究结果表明,检测出的显著关联SNP数目随群体规模及两尾比例的减小而减少。初步确定两尾选择标准为:遗传力为0.38左右的性状,样本量为2 000、1 500、1 000、500,两尾选择比例分别为8%、10%、10%、20%;遗传力为0.50左右的性状,样本量为2 000、1 500、1 000、500,两尾选择比例分别为5%、5%、10%、15%。以此标准为基础进行GWAS,既能有效检测出最显著SNP位点或区间,又能最大程度地降低研究成本,提高研究效率。

分类号： S813.1

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