猪源脑心肌炎病毒GXLC株全基因组序列测定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 施开创

作者： 施开创;屈素洁;陈进喜;许瑞胜;郑敏;刘棋;陈汉忠;李刚

作者机构：

关键词： 猪;脑心肌炎病毒;基因组;同源性比较;系统进化分析

期刊名称： 病毒学报

ISSN： 1000-8721

年卷期： 2010 年 26 卷 02 期

页码： 134-142

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对猪源脑心肌炎病毒(EMCV)GXLC株进行全基因组克隆、测序和分析。采用RT-PCR技术分段扩增基因组可读框(ORF),应用3'-RACE和5'-RACE技术扩增3'-UTR和5'-UTR,分别对扩增片段进行克隆和测序,经拼接后获得GXLC株全基因组序列,共7725个核苷酸。与NCBI GenBank登录的国内外参考毒株进行同源性比较及系统进化分析结果表明,GXLC株与GX0601、GX0602、BJC3、HB1等国内分离株以及CBNU、K3、K11、BEL-2887A、EMCV-R、PV21等国外分离株同源性达99%以上;基于全基因组、结构蛋白及非结构蛋白基因序列绘制的系统进化树拓扑结构图相近,所有EMCV分离株可分成两个群:I群和II群,I群可细分为Ia亚群和Ib亚群,其中猪源EMCV属于Ia或Ib亚群、鼠源EMCV属于Ia亚群、野猪源EMCV属于II群,GXLC株与其它中国分离株均属于Ia亚群。

分类号： S852.659.6

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