利用EcoTILLING简化技术进行水稻基因型鉴定及单核苷酸多态性(SNP)检测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 滕斌

作者： 滕斌;李泽福;罗志祥;吴敬德;朱学桂;宣红;张瑛

作者机构：

关键词： EcoTILLING;CEL Ⅰ;水稻;基因型;SNP

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2012 年 20 卷 03 期

页码： 254-260

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： EcoTILLING(ecotype targeting induced local lesions in genomes)是一种高通量检测和分析自然群体中单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)变异的研究方法。由于该技术需要高级、精密的仪器设备和昂贵的荧光标记引物来检测CEL(celery)Ⅰ的酶切产物,极大地限制了该技术的应用。本研究对传统EcoTILLING技术做了适当改进,简化了CELⅠ酶的抽提步骤,采用自然冷却方法制备异源双链产物,普通银染检测CELⅠ酶切产物,酶活检测结果显示CELⅠ粗提液对错配产物切割效果良好。利用EcoTILLING简化技术对18份水稻(Oryza sativa L.)品系Wx基因第1内含子5'端的G/T基因型进行了成功鉴定。此外,对18份水稻材料中一417bp长的Wx基因片段实现了CELⅠ酶切条带分型,经测序验证,酶切带型差异能够准确反映材料间SNP的变异。本研究结果表明,应用EcoTILLING简化技术可有效进行水稻基因型鉴定及SNP检测,是开展水稻功能基因组研究的有力工具。

分类号： S511

  • 相关文献

[1]EcoTILLING技术及其应用. 李建春,李锡香,宋明. 2007

[2]EcoTILLING高通量分析甘蓝型油菜种质叶绿体rps16基因的多态性. 蔡梦鲜,乔江伟,闫贵欣,吴金锋,李再云. 2014

[3]茶树简化EcoTILLING技术的建立. 金基强,陈亮,姚明哲,王新超,马春雷. 2010

[4]高分辨率溶解曲线分析技术在大豆Ecotilling中的应用. 焦丽,刘相国,杨春明,王虎义,郝东云,王庆钰. 2011

[5]糯玉米‘沪五彩花糯1号’品系特异性2b-RAD分子标记的开发及应用. 李全林,王义发,韩晴,袁政,沈雪芳. 2016

[6]滩羊肥胖基因(OB)TaqMan探针SNP分型研究. 马丽娜,于洋. 2017

[7]基于基因分型技术的燕麦SNP标记研究. 董艳辉,刘龙龙,温鑫,于宇凤,杨方,刘根科,崔林,曹秋芬,秦永军. 2019

[8]MC1R基因多态性与杜黑猪毛色关系研究. 巩静,杨晴,王艺盼,王彦平,朱晓东,张传生,耿立英,王继英. 2023

[9]连续增氧对不同基因型水稻分蘖期生长和氮代谢酶活性的影响. 赵锋,张卫建,章秀福,王丹英,徐春梅. 2011

[10]连续增氧对不同基因型水稻分蘖期生长和氮代谢酶活性的影响. 赵锋,张卫建,章秀福,王丹英,徐春梅. 2012

[11]一种基于PCR的水稻SNP标记检测方法. 王钰,许学,秦瑞英,陆徐忠,李莉,杨剑波,倪金龙,马卉,汪秀峰. 2020

[12]水稻苗期耐亚铁毒和锌毒胁迫的关联分析. 张建,王小倩,向小娇,申聪聪,徐建龙. 2015

[13]利用双向回交导入系定位水稻苗期耐亚铁毒和锌毒的QTL. 张建,Aijaz Ahmed SOOMRO,柴路,崔彦茹,王小倩,郑天清,徐建龙,黎志康. 2013

[14]不同早籼基因型水稻的空间诱变效应研究. 严文潮,徐建龙,俞法明,鲍根良,金庆生. 2004

[15]超声波处理对不同基因型水稻产量形成的影响. 肖立中,莫钊文,聂俊,闻祥成,李媛,刘琪,唐湘如. 2014

[16]水稻幼苗镉积累特征和离体叶片耐镉性的基因型差异. 王龙,杨益新,高子平,尹洁,刘洋,张长波,汤继华,刘仲齐. 2016

[17]不同基因型粳稻籽粒产量与功能成分的生态变异. 杨树明,夏小环,赵旭,方晓东,杜娟. 2012

[18]不同基因型水稻糙米对镉、铅的吸收特性. 江川,朱业宝,陈立喆,张丹,王金英. 2019

[19]抗稻瘟病基因Pi-ta、Pi-b、Pi54和Pikm在黄淮稻区水稻品种资源中的抗性分布. 王宝祥,刘艳,邢运高,迟铭,徐波,杨波,李健,孙志广,刘金波,陈庭木,卢百关,方兆伟,徐大勇. 2019

[20]不同基因型水稻在贮藏过程中米质性状的变化. 李清华,郑长林,郑苹立. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序