生物软件在序列分析过程中的运用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 邵西群

作者： 邵西群;巴恒星;李志鹏;章秀婷;杨福合

作者机构：

关键词： 生物序列;检索;分析;软件

期刊名称： 生物信息学

ISSN： 1672-5565

年卷期： 2010 年 08 卷 04 期

页码： 321-324+329

收录情况： CSCD

摘要： 介绍了组合使用BLAST、FASTA/BLASTScan3.2,或用多序列比对软件,从数据库中快速提取大数量目标序列,最后用MEGA4快捷编辑整理大数量序列的方法。还介绍了一种生成核酸序列与其氨基酸序列相似性百分率整合表格的方法。简述了对引物设计的基本认识并介绍了多重引物兼容性筛选软件;对构建系统发育树的认识并引出分子进化树构建软件MEGA4的使用和PAUP 4.0常用建树命令模块。期望这些方法和软件的使用能解决生物序列分析过程的常见问题。

分类号： Q75

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