大口黑鲈肌球蛋白重链基因SNPs的筛选及与生长性状的关联
文献类型: 中文期刊
第一作者: 李胜杰
作者: 李胜杰;姜鹏;樊佳佳;白俊杰;李锐;朱新平
作者机构:
关键词: 大口黑鲈;肌球蛋白重链基因;单核苷酸多态性标记(SNP);生长性状;关联分析
期刊名称: 水产学报
ISSN: 1000-0615
年卷期: 2018 年 03 期
页码: 305-313
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 肌球蛋白是肌肉细胞的重要组成成分,影响肌纤维的组成和肌肉生长。为了研究肌球蛋白重链(MYH)基因多态性与大口黑鲈生长性状的相关性,本研究采用PCR技术扩增得到编码区序列全长为9759 bp的大口黑鲈MYH基因,该基因包含37个外显子和36个内含子,编码1940个氨基酸。采用直接测序法在MYH基因上筛选到8个单核苷酸多态性标记(SNP)位点(A-305G、G-558C、A-2784C、A-2816G、T-4765A、C-6206T、C-6811T和G-6935T),有4个位于外显子上,其中2个属于同义突变。用SNa Pshot方法对从同批繁殖、同塘养殖的大口黑鲈"优鲈1号"群体中随机选取的430尾个体中各位点的基因型进行检测。结果显示,内含子上的A-2784C和A-2816G位点完全连锁,所有位点在大口黑鲈"优鲈1号"群体中的平均有效等位基因数、平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为1.635、0.406和0.373,仅C-6206T、C-6811T和T-4765A位点的基因型频率分布符合Hardy-Weinberg定律。采用一般线性模型分析各位点与大口黑鲈生长性状之间的相关性,研究发现,C-6811T位点CC基因型个体的体质量和全长显著大于TT基因型,CC基因型个体的体高和尾柄长显著大于CT和TT基因型,其余位点不同基因型个体间的生长性状均不存在显著差异。C-6811T位点与生长性状显著相关,可作为大口黑鲈分子标记辅助育种的候选标记。
分类号: S917.4
- 相关文献
[1]大口黑鲈生长性状的微卫星DNA标记筛选. 樊佳佳,白俊杰,李小慧,何小平,何小燕,李胜杰,叶星,吴立新. 2009
[2]大口黑鲈HSC70-1基因多态性及其双倍型与生长性状的关联分析. 李胜杰,樊佳佳,姜鹏,白俊杰,孙建国,吴建开,费志平. 2018
[3]大口黑鲈生长相关标记的聚合及其效果分析. 李胜杰,姜鹏,白俊杰,樊佳佳,费志平. 2019
[4]基于转录组测序的大口黑鲈驯食相关SNP开发及其与生长性状的关联分析. 马冬梅,全迎春,樊佳佳,胡婕,白俊杰,刘浩. 2018
[5]大口黑鲈NPY基因多态性及与生长的关联分析. 李胜杰,刘浩,白俊杰,吴建开,马冬梅,费志平,樊佳佳,孙建国. 2018
[6]大口黑鲈转录组SNPs筛选及其与生长的关联分析. 全迎春,马冬梅,白俊杰,刘浩,李胜杰,刘海涌. 2016
[7]大口黑鲈生长性状的遗传参数和育种值估计. 李镕,白俊杰,李胜杰,王解香,叶星. 2011
[8]大口黑鲈2群体双列杂交子代的生长比较及通径分析. 龚雅婷,傅建军,朱文彬,张林兵,王兰梅,强俊,郜灿,胡桂飞,洪斌,董在杰. 2022
[9]基于RAD-seq的大口黑鲈选育群体快长SNP挖掘及其与生长性状的关联分析. 华吉祥,陶易凡,李岩,王庆春,陈文华,诸葛燕,张茂友,董亚伦,路思琪,姜冰洁,强俊. 2024
[10]大口黑鲈EST-SNP标记开发及其与生长性状的相关性分析. 李胜杰,白俊杰,赵荦,朱冰,朱新平. 2018
[11]大口黑鲈肌肉生长抑制素基因单核苷酸多态性位点的筛选及其与生长性状关联性分析. 于凌云,白俊杰,樊佳佳,李小慧,叶星. 2010
[12]大口黑鲈POU1F1启动子区域SNPs对生长的影响. 杜芳芳,白俊杰,李胜杰,李小慧,樊佳佳. 2011
[13]大口黑鲈载脂蛋白基因序列单核苷酸多态性及与生长性状相关分析. 李胜杰,景燕娟,白俊杰,孙建国,吴建开,费志平. 2018
[14]关岭黄牛POMC基因多态性及其与生长性状的关联性分析. 徐龙鑫,朱丽莉,张麟,刘镜,何光中. 2016
[15]斑点叉尾MSTN基因4个SNP位点及其与生长性状的相关性. 张世勇,王明华,钟立强,秦钦,潘建林,陈校辉,边文冀. 2017
[16]GHRL基因5'侧翼区多态性对鸡生长和屠体性状的影响. 方梅霞,徐海平,谢亮,梁伟涛,赖泽颖,张德祥,聂庆华,张细权. 2011
[17]斑点叉尾GHRH基因3个SNPs位点及其单倍型组合与生长性状的关联分析. 张世勇,钟立强,秦钦,王明华,潘建林. 2016
[18]西藏牦牛MyoD1基因多态性及与生长性状的关联性分析. 黄兴,柴志欣,王会,姬秋梅,信金伟,钟金城. 2019
[19]泥蚶G2代快速生长家系遗传结构的微卫星分析及其与生长性状的关联. 滕爽爽,方军,邵艳卿,林兴管,柴雪良,肖国强. 2018
[20]IGF-1R基因SNPs检测及其与水貂生长性状的关联分析. 宋姗姗,刘宗岳,丛波,刘琳玲,宋兴超,彭英华. 2019
作者其他论文 更多>>
-
线纹尖塘鳢性别相关的2个dmrt基因结构特征及表达规律
作者:樊佳佳;马冬梅;朱华平;林明辉;钟再选;田园园
关键词:线纹尖塘鳢;Oxldmrt1;Oxldmrt3;基因结构;基因表达;荧光原位杂交
-
不同大口黑鲈群体耐热性分析及高温对鳃组织和抗氧化酶活性的影响
作者:谢玉净;李胜杰;杜金星;朱涛;宋红梅;雷彩霞;温绮乔
关键词:大口黑鲈;急性高温胁迫;半数致死温度;组织损伤;抗氧化酶
-
草鱼不同月龄性腺组织学观察及性别特征基因cyp19a1a和amh的表达分析
作者:祁博;李胜杰;杜金星;肖小芳;张东云;朱涛;雷彩霞;刘志军;宋红梅
关键词:草鱼;性别分化;组织切片;基因表达
-
高粱功能着丝粒的鉴定及序列组成分析
作者:戴妍;周嘉亮;姜鹏;王为;王凯
关键词:高粱;功能着丝粒;着丝粒重复序列;CENH3;染色质免疫共沉淀
-
玉米机械化播种关键技术与装备研究进展
作者:花登峰;姜鹏;高进;施洋;孙健雄;陆镇威;王海洋;程芳梅;杨华;王为
关键词:玉米;播种;直播;移栽;机械化;精准农业
-
高嘌呤饮食对金黄地鼠血脂变化和病理损伤的影响
作者:贺亮;李庆香子;李锐
关键词:金黄地鼠;尿酸;血脂;肾损伤
-
加州鲈主要病毒病诊断与防控策略(上)
作者:曾令兵;王旭军;李胜杰
关键词: