辣椒氨基转移酶pAMT基因家族在基因组中的分布分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘冬梅

作者： 刘冬梅;洪权春;陈文超;丁锦平;陈姝彤;徐园园;韩霜;朱晓琴;王亚月;裴冬丽

作者机构：

关键词： 辣椒素;pAMT;基因家族;生物信息学分析

期刊名称： 辣椒杂志

ISSN： 1672-4542

年卷期： 2019 年 003 期

页码： 1-8

摘要： 为研究辣椒氨基转移酶(pAMT,putative aminotransferase)基因在辣椒基因组中的分布和功能,以尊辣1号基因组为参照,利用生物信息学方法对辣椒中pAMT基因家族成员进行全基因组水平分析.结果显示:辣椒基因组中存在9个pAMT基因家族成员,集中分布在8号和9号染色体上,氨基酸序列多重比对显示这9个蛋白分别聚类到3大分支上.结构分析表明,pAMT家族所有蛋白均含有5个保守结构域Motif 2、Motif 3、Motif 5、Motif 8和Motif 9.基因表达分析结果显示:基因Capana09g000427在叶片中不表达,在果皮中表达量最高,其次是子房,在种子和胎座也有表达.基因Capana08g000160在种子、胎座中不表达,仅在叶片中表达稍高,在其他组织的表达量均较低.辣椒氨基转移酶pAMT基因家族在基因组中的分布分析为进一步研究辣椒氨基转移酶pAMT基因家族的功能提供了科学依据.

分类号： S641.3

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