辣椒氨基转移酶pAMT基因家族在基因组中的分布分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘冬梅

作者： 刘冬梅;洪权春;陈文超;丁锦平;陈姝彤;徐园园;韩霜;朱晓琴;王亚月;裴冬丽

作者机构：

关键词： 辣椒素;pAMT;基因家族;生物信息学分析

期刊名称： 辣椒杂志

ISSN： 1672-4542

年卷期： 2019 年 003 期

页码： 1-8

摘要： 为研究辣椒氨基转移酶(pAMT,putative aminotransferase)基因在辣椒基因组中的分布和功能,以尊辣1号基因组为参照,利用生物信息学方法对辣椒中pAMT基因家族成员进行全基因组水平分析.结果显示:辣椒基因组中存在9个pAMT基因家族成员,集中分布在8号和9号染色体上,氨基酸序列多重比对显示这9个蛋白分别聚类到3大分支上.结构分析表明,pAMT家族所有蛋白均含有5个保守结构域Motif 2、Motif 3、Motif 5、Motif 8和Motif 9.基因表达分析结果显示:基因Capana09g000427在叶片中不表达,在果皮中表达量最高,其次是子房,在种子和胎座也有表达.基因Capana08g000160在种子、胎座中不表达,仅在叶片中表达稍高,在其他组织的表达量均较低.辣椒氨基转移酶pAMT基因家族在基因组中的分布分析为进一步研究辣椒氨基转移酶pAMT基因家族的功能提供了科学依据.

分类号： S641.3

  • 相关文献

[1]荔枝漆酶(LAC)基因家族鉴定及表达分析. 李郑华,姜成东,王鹏,李芳,王树军,刘耀婷,李焕苓,王果,王家保. 2023

[2]绵羊MYL基因家族的鉴定与组织表达分析. 杨杨,余乾,刘昱成,杨华,赵卓,王立民,周平,杨庆勇,代蓉. 2024

[3]菠萝酸性转化酶基因家族初步生物信息学及表达分析. 宋康华,侯晓婉,贾志伟,洪克前,谷会,张鲁斌. 2020

[4]猕猴桃LysM型类受体激酶基因家族生物信息学分析. 何蕾,王文霞,胡容平,尹恒. 2023

[5]乌拉尔图小麦NBS-LRR家族生物信息学分析. 刘小芳,袁欣,聂迎彬,张晶. 2018

[6]水稻干扰素相关发育调节因子的生物信息学分析. 和亚男,李稳,尹俊雅,谢先芝. 2021

[7]香蕉高亲和性钾转运蛋白(HAK)家族全基因组鉴定及表达. 田娜,王斌,伍俊为,武欢,刘嘉鹏,刘范,邓贵明,黄玉吉,程春振. 2022

[8]基于苋菜转录组的TCP基因家族成员鉴定及表达分析. 安子贤,李宜轩,郑友峰,肖昉,王乐,陈何,赖钟雄,牟建梅,刘生财. 2022

[9]水稻三结构域多铜氧化酶基因家族生物信息学分析. 谭炎宁,张超,殷小林,何强,肖应辉,邓华凤. 2019

[10]花椒麻素和辣椒素降血脂机理的研究. 陈朝军,李俊,王辉,吕都,刘辉,刘永翔. 2016

[11]复合型肥料对辣椒素及其相关次生代谢物质积累的影响与相关分析. 苏丹,蓬桂华,韩世玉,耿广东. 2016

[12]索氏提取法制备辣椒素的工艺研究. 夏延斌,丁芳林. 2007

[13]索氏提取法制备辣椒泰的工艺研究. 夏延斌,丁芳林. 2007

[14]不同肥料对朝天椒中辣椒素及相关物质的影响. 苏丹,蓬桂华,付文婷,韩世玉,邢丹. 2015

[15]不同类型辣椒中辣椒素含量测定及辣度分析. 常晓轲,张强,韩娅楠,张涛,刘卫,程志芳,张晓伟,张英,姚秋菊. 2019

[16]花椒麻素和辣椒素对大鼠体内脂质的调节作用. 陈朝军,李俊,王辉,吕都,刘辉,刘永翔,刘庆庆,刘雄. 2017

[17]4个高辣素辣椒品种在罗甸县的适应性评价. 付文婷,吴迪,何建文,詹永发,黄冬福,范高领,吴康云. 2020

[18]辣椒果实中辣椒素的研究进展. 袁雷,杨涛,张国儒,郭河瑶,唐亚萍,杨生保. 2021

[19]酶联免疫法测定辣椒中辣椒素含量. 杨东顺,梅文泉,龙洪进,黎其万. 2015

[20]茄科植物中HCT基因家族的鉴定及进化和表达分析. 李倩,盖江涛,白蓓蓓,叶秀旭,王鹏. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序