鲁中肉羊TSHR多态性与产羔数的关联及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈炜昊

作者： 陈炜昊;潘林香;王金文;马琳;孙伟;储明星

作者机构：

关键词： 鲁中肉羊;TSHR;SNP分型;产羔数;生物信息学

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN：

年卷期： 2020 年 009 期

页码：

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究旨在探究TSHR基因g.89431097C>G位点多态性与鲁中肉羊产羔数之间的关系,并进行相关生物信息学分析,以期为TSHR基因编码蛋白功能机制研究提供基础数据并为鲁中肉羊高繁殖力分子育种提供新的遗传标记.利用全基因组重测序结合Sequenom MassARRAY?SNP技术对鲁中肉羊TSHR基因g.89431097C>G位点进行检测,并与其产羔数进行关联分析,利用Protparam等软件对TSHR基因进行生物信息学分析.分型结果表明:g.89431097C>G位点存在GG、GC和CC 3种基因型;群体遗传学分析表明,g.89431097C>G位点在鲁中肉羊中表现为中度多态(0.250.05);关联分析表明,g.89431097C>G位点GG型第一胎、第二胎、第三胎产羔数均显著高于GC与CC型(p<0.05).生物信息学分析表明绵羊TSHR基因编码764个氨基酸组成不稳定碱性疏水性蛋白,存在信号肽,存在7个跨膜域,预测存在6个N-糖基化位点、6个O-糖基化位点和85个磷酸化位点,预测存在二硫键,绵羊与山羊、家牛等12个物种TSHR基因编码区生物进化高度保守.

分类号： S826

  • 相关文献

[1]鲁中肉羊BMP4基因g.63454744 T>G位点多态性与产羔数的关联分析. 文禹粱,潘林香,王金文,马琳,赵生国,储明星. 2019

[2]鲁中肉羊HIRA基因多态性及其与产羔数的关联分析. 张仁森,刘秋月,潘林香,王金文,王翔宇,胡文萍,马琳,狄冉,储明星. 2019

[3]鲁中肉羊GLIS1基因多态性及其与产羔数的关联分析. 张壮彪,潘林香,王金文,贺小云,储明星. 2020

[4]鲁中肉羊PAPPA2基因多态性与其产羔数的关联分析. 刘明秋,喇永富,潘林香,王金文,王媛媛,胡文萍,储明星. 2020

[5]鲁中肉羊BMPR1B、BMP15和GDF9基因多态性与产羔数关联分析. 孙庆,田志龙,刘秋月,潘林香,王金文,储明星. 2019

[6]鲁中肉羊育种中FecB突变应用效果分析. 陶林,潘林香,王金文,贺小云,王凤艳,狄冉,储明星. 2020

[7]绵羊PTGS2基因多态性与产羔数关联分析. 安雪姣,赵生国,潘章源,马琳,蔡原,储明星. 2020

[8]绵羊PRLR和CARTPT基因多态性与产羔数的关联分析. 李芝丰,孙伟,储明星. 2020

[9]山羊ERBB2和SLC38A6基因多态性与产羔性能的关联分析. 常成,陶林,梁琛,江炎庭,欧阳依娜,储明星,洪琼花. 2022

[10]绵羊SPP1和PLCB3基因多态性与产羔数的关联分析. 刁婉莹,狄冉,储明星. 2021

[11]绵羊PRLR# CARTPT基因多态性与产羔数的关联分析. 李芝丰,孙伟,储明星. 2020

[12]绵羊CD9基因g.208082881C>A位点多态性与产羔数的关联分析. 汤继顺,狄冉,刘秋月,王翔宇,胡文萍,储明星. 2018

[13]SIX1基因表达及其多态性与绵羊季节性繁殖和产羔数的关联分析. 李春艳,狄冉,张彦,任春环,张子军,刘秋月,胡文萍,王翔宇,张效生,张金龙,储明星. 2018

[14]山羊CHRNA7和CRYM基因多态性与产羔性能的关联分析. 余平,狄冉,江炎庭,杨红远,洪琼花,储明星. 2022

[15]绵羊MKRN3基因多态性与产羔数的关联分析. 陈炜昊,田志龙,孙伟,储明星. 2019

[16]绵羊SMAD1基因组织表达及其多态性与产羔数关联分析. 田志龙,汤继顺,孙庆,王玉琴,张效生,张金龙,储明星. 2019

[17]Clock基因多态性与不同发情模式绵羊产羔数的关联分析. 陈炜昊,田志龙,孙伟,储明星. 2023

[18]绵羊FLRT3基因多态性及其与产羔数关联分析. 张仁森,刘秋月,王翔宇,胡文萍,马琳,狄冉,储明星. 2019

[19]绵羊FLI-1基因多态性与产羔数的关联分析. 陈思,狄冉,刘秋月,王翔宇,储明星. 2020

[20]绵羊KISS1基因组织表达及其多态性与产羔数关联分析. 安雪姣,赵生国,潘章源,文禹粱,田志龙,蔡原,储明星. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序