基于生物信息学方法的小鼠精子发生关键基因筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李欣

作者： 李欣;田佳;脱征军;邵怀峰;张伟新;李委奇;王琨;徐寒;温万

作者机构：

关键词： 精子发生;生物信息学分析;差异基因

期刊名称： 中国畜牧杂志

ISSN： 0258-7033

年卷期： 2021 年 57 卷 002 期

页码： 84-89

收录情况： 北大核心

摘要： 为探索精子发生的分子机制,寻找精子变形期间的关键基因,本研究从公共基因表达数据库下载小鼠精细胞的转录组测序数据,利用R软件Ballgown程序包筛选差异表达基因,并对差异表达基因进行Gene ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析后,再对筛选出的关键基因进行分析.结果 显示:筛选出8个相关性较强的关键通路,将其所包含的基因进行FPKM值从大到小排序,取前18名的基因进行功能分析.其中,Txnrd3和Tcp1与繁殖活动相关;Gpx4、Dkkl1、Dbil5与发育相关;Prm2、Selenof、Tnp1、Tnp2、Ropn1l、Pafah1b2、Spink2和Prm1等8个基因参与精子发生;Spa17、Ldhc、Hsp90aa1、Gstm5和Csnk2b参与鞭毛和纤毛的形成.以上基因对精子发生具有重要作用,深入发掘这些基因的功能特点可为进一步揭示精子变形机制提供理论依据.

分类号： Q811.4

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