旱稻孢囊线虫在广西的发生及其rDNA-ITS异质性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 卓侃

作者： 宋汉达;王宏洪;陶冶;张洪玲;陆秀红;黄金玲;刘志明;廖金铃

作者机构：

关键词： 旱稻孢囊线虫;水稻;鉴定;rDNA-ITS;异质性

期刊名称： 中国水稻科学

ISSN： 1001-7216

年卷期： 2014 年 28 卷 01 期

页码： 78-84

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 2011年,从广西龙胜梯田的水稻根系和稻田土壤中分离到一种孢囊线虫。该线虫形态特征与已报道的旱稻孢囊线虫(Heterodera elachista)相符,其rDNA-ITS序列与GenBank中旱稻孢囊线虫的rDNA-ITS序列相似性为97.7%~99.3%。rDNA-ITS分子发育树表明该线虫与旱稻孢囊线虫以100%的置信度及较小的遗传距离形成一个单系,据此将该线虫鉴定为旱稻孢囊线虫。进一步对本研究获得的10条旱稻孢囊线虫rDNA-ITS区序列及Tanha Maafi等报道的1条旱稻孢囊线虫rDNA-ITS序列(AF498391)的酶切位点进行分析,结果发现AluⅠ、AvaⅠ、MvaⅠ和RsaⅠ4个内切酶的酶切位点在11条序列中完全一致,而Bsh1236Ⅰ、BsuRⅠ和CfoⅠ3种酶的酶切位点存在变异,其中Bsh1236Ⅰ和BsuRⅠ有2种变异型,CfoⅠ则有3种变异型,表明旱稻孢囊线虫的rDNA-ITS序列存在DNA异质性。

分类号： S435.112

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