中国甘薯双生病毒C4基因分子变异及遗传多态性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐振

作者： 徐振;孙厚俊;赵永强;杨冬静;谢逸萍

作者机构：

关键词： 甘薯双生病毒;C4基因;分子变异;遗传多态性

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2017 年 03 期

页码： 487-492

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 甘薯双生病毒是中国甘薯上一种重要的病毒,其C4基因编码的蛋白是一个多功能蛋白,参与了寄主症状的形成及病毒在植物体内移动等。本研究利用PCR方法扩增了24个分离物的C4基因,通过SDT、Dna SP等软件分析,结果表明,24个分离物核苷酸序列均为258个碱基,一致率为73.3%~100.0%,编码85个氨基酸,一致率为47.1%~100.0%。中国甘薯双生病毒分离物C4基因构建系统进化树分为2个组,组Ⅰ包括本研究的15个双生病毒分离物及中国大部分双生病毒分离物,又分为2个亚组,亚组2仅有15个双生病毒分离物,其中本研究的6个分离物位于此亚组;组Ⅱ含有30个双生病毒分离物,包括本研究的9个分离物。非同义突变与同义突变比值大于1,说明C4基因处于正向选择。亚组1错配分布图为单峰,说明该组种群呈突然暴发的状态,其余组或亚组为多峰锯齿状,表明种群或者亚种群已经存在很长时间,长期处于动态平衡。

分类号： S435.31

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