基于InDel标记挖掘与番茄果实性状相关的候选基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 董洁

作者： 董洁;王娜;火顺利;李宁;余庆辉

作者机构：

关键词： 番茄;插入/缺失标记(InDel);果实;QTL;候选基因

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2024 年 32 卷 07 期

页码： 1494-1503

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 番茄(Solanum lycopersicum)作为一年生草本植物，含有丰富的营养物质，随着市场需求的变化，培育高产优质的番茄品种成为育种的主要目标之一。番茄果实种子数、可溶性固形物、横径和纵径对提高其产量和品质具有重要的意义。本研究通过插入/缺失(insertion/deletion, InDel)标记进行番茄果实种子数、可溶性固形物、横径和纵径的QTL定位，基于RNA-seq挖掘候选基因。本研究以果实种子数少、可溶性固形物含量低、横径和纵径小的'小花番茄'为父本，以果实种子数多、可溶性固形物含量高、横径和纵径大的'M82'为母本，通过杂交得到60个家系的F2群体。通过对表型数据的调查，进行相关性和聚类分析。以番茄的基因组信息为基础，挖掘与番茄果实性状相关的候选基因。结果表明，'小花番茄'和'M82'及其杂交的60个家系的F2番茄材料种子数、可溶性固形物含量、纵径和横径的变异系数均大于10%，偏度和峰度显示这4个性状均服从正态分布，种子数与可溶性固形物含量、纵径和横径正相关，可溶性固形物含量与纵径和横径负相关，纵径和横径正相关。25对亲本间多态性InDel标记在62份番茄中，共检测到149个位点。非加权组平均法(unweighted pair-group method with arithmetic means, UPGMA)聚类分析表明，在遗传相似性系数为0.70～0.75时，62份番茄可分为4类。基于25对多态性InDel标记，总计得到5个QTL，挖掘到4个候选基因，并通过RNA-seq分析了候选基因的表达模式，Solyc12g027770同时在种子数和可溶性固形物被定位到。本研究为番茄果实种子数、可溶性固形物和纵径的遗传解析和分子机制研究及分子标记开发提供了参考。

分类号： S641.2

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