短花针茅SSR-PCR反应体系的建立及引物筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵磊

作者： 赵磊;党振华;赵艳宁;张颖;牛建明

作者机构：

关键词： 短花针茅;SSR-PCR;体系优化;引物筛选

期刊名称： 内蒙古大学学报(自然科学版)

ISSN： 1000-1638

年卷期： 2016 年 01 期

页码： 58-64

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以采集于我国内蒙古高原、黄土高原和新疆等地的6个短花针茅野生种群为材料,采用正交实验的方法对模板DNA、Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶和引物浓度进行5因素4水平的正交优化设计,依据同源物种紫花针茅的19对SSR引物筛选适用于短花针茅的SSR引物.结果表明:(1)短花针茅最佳SSR-PCR反应体系为(25μL):100ng模板DNA 1μL、2.0mmol/L的Mg2+2.5μL、100μmol/L dNTPs 2μL、2.0U Taq DNA聚合酶0.5μL、0.2μLmol/L上下游引物各1μL,其余用ddH2O补足.(2)建立了重复性和稳定性较好的SSR-PCR扩增程序:94℃预变性3min;94℃变性30s,退火温度与每个引物相对应,退火30s,72℃延伸30s,共30个循环;最后72℃延伸10min;4℃保存,扩增结束.(3)筛选出7对多态性较好的短花针茅SSR引物,同属植物基因组SSR引物的通用率为36.84%.本研究对于进一步探讨短花针茅种群遗传多样性提供参考价值.

分类号： S543.9

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